具体包括：儿童急慢性腹泻、腹痛、嗜酸细胞性胃肠炎、儿童过敏性胃肠炎、急慢性胰腺炎、胃食管反流、消化道出血、幽门螺杆菌感染、胃炎、消化性溃疡的诊断和治疗；儿童炎症性肠病（克罗恩病和溃疡性结肠炎，包括极早发型炎症性肠病）的诊断和治疗，尤其在极早发型炎症性肠病的基因诊断和脐血干细胞移植治疗方面有较丰富的临床经验。
在内镜诊疗方面，开展24小时食管下端pH值检测、电子胃镜、电子结肠镜、胶囊内镜、超声内镜、双气囊小肠镜等检查；消化道出血急诊胃镜检查和治疗；开展内镜下的微创治疗，如上消化道异物钳取、胃肠息肉摘除、食管胃底静脉曲张内镜治疗、经口内镜下肌切开术（POEM术）、经皮内镜下胃造瘘术等。
主要成绩及特色本专业致力于提高儿童常见、罕见以及疑难消化系统疾病的综合诊疗能力，并规范地进行专病临床信息系统化管理（专科门诊-病房-随访）。2006年成立全国首个儿童炎症性肠病俱乐部，俱乐部成员已超过250个家庭；2015年成立国内首个儿童炎症性肠病多学科团队，并成立复旦大学附属儿科医院炎症性肠病诊治研究基地；2017年成立国内首个儿童疑难胃肠病救助基金--玖久专项基金，救治患儿来自全国大部分省市以及香港地区等，定期举办炎症性肠病俱乐部、玖久科普小讲堂、微信科普等活动，对患儿和患儿家属进行专病随访、内镜复查、健康宣教、治疗经验分享，同时也和国外多所著名大学（如加拿大SickKids医院、美国波士顿大学、佛罗里达大学、辛辛那提儿童医院、英国牛津大学、德国墨尼黑大学、荷兰阿姆斯特丹儿童医院、鹿特丹儿童医院等）保持着密切的学术交流和联系，提升国内儿童炎症性肠病的诊疗研究水平，推动儿童炎症性肠病多学科、国际多中心合作及诊治规范化，并就炎症性肠病的发病机制和新的治疗策略进行临床和基础研究，为提高救治率和患儿的生存质量做出积极的努力。另外在内镜下微创治疗方面亦有突出成绩，率先在国内开展儿童贲门失弛缓和食道胃底静脉曲张的内镜下微创治疗，至今完成儿童贲门失弛缓内镜微创治疗（POEM术）30例、食道胃底静脉曲张内镜下治疗30余例。
所获成果临床方面：年消化专科门诊量超80000人，在上海乃至全国儿童医院位居榜首。2015年国内首例通过基因诊断IL-10基因缺陷极早发型炎症性肠病，并通过脐血干细胞移植治疗获得成功，至今脐血干细胞移植患儿超过20例。常规胃肠镜检查每年6000余例，其中三级、四级内镜手术千余例，位居上海各大儿童医院之首，胃肠镜检查涉及新生儿和小婴儿，同时开展消化道息肉内镜治疗、经皮内镜下胃造瘘术、食道胃底静脉曲张出血、儿童贲门失弛缓内镜微创治疗等。2006年首先运用双气囊小肠镜对小肠粘膜进行深入检查，对儿童不明原因便血、慢性腹泻、慢性腹痛、炎症性肠病等具有很好的诊断和治疗价值；2007年应用超细胃镜经鼻进行儿童胃镜检查，最大限度减轻受检患儿的不适感。2014年开展儿童经口内镜下肌切开术，并对世界范围内年龄最小儿童（11月女婴）成功实施该手术。
科研方面：申请到“儿童炎症性肠病”相关的国家自然科学基金、市级、局级相关课题多项，2011年入选卫生部国家临床重点专科建设项目。参与多项消化系统疾病的临床和基础研究（包括炎症性肠病、肠道微生态、儿童幽门螺杆菌感染等）；每年主办国家级继续教育学习班；2016年成功举办首届儿童炎症性肠病国际高峰论坛。积极在国外及国内核心期刊发表论著，如IBD杂志4篇、以及GIEndoscopy、AmJNutrition等，执笔“中国儿童幽门螺杆菌感染诊治专家共识”的撰写，并定期参加国内外学术大会并进行相关大会发言。
人才状况本科室具有一支梯队合理、技术精湛的医疗队伍。现有专科医生20名，专科内镜护士1名。其中正高1名，副高6名，主治医生9名，高年住院4名，博士学位5人，硕士学位13人。参与研究生的培养工作，目前博士研究生导师1人，已培养博士研究生3人、硕士研究生14人，正培养博士研究生4人、硕士研究生4人。本专科医护人员多次赴美国、德国、加拿大、荷兰、澳大利亚、英国、新加坡、香港、日本等地进行基础实验研究及访问学习交流。
专业特色本科室拥有独立的病房、门诊、内镜中心，是集临床、科研、教学为一体的综合性科室，科室宗旨：一切“胃”了孩子，共筑健康“肠”城。
医疗：本专科特色包括儿童炎症性肠病（包括极早发型炎症性肠病）、儿童幽门螺旋杆菌的诊断和治疗、儿童内镜诊疗（新生儿胃肠镜、双气囊小肠镜检查及内镜下的微创治疗等）及胃肠道慢性病患儿营养支持等；定期进行炎症性肠病-多学科协作（IBD-MDT）学术研讨会，并及时与国外著名专家保持学术联系，加强国际多中心合作；在患儿随访方面，我科拥有多样化的随访模式，包括门诊随访、电话随访、微信交流等，目前已开设玖久关爱儿童炎症性肠病、复旦儿科炎症性肠病诊治研究基地微信公众号，定期科普医学常识，并安排专人管理预约随访以及化验结果的及时跟进等。
教学：作为复旦大学研究生培养点，参与硕士、博士研究生的培养工作。参与复旦大学医学院八年制消化系统疾病章节的慕课教学和五年制大学生的大课教学；复旦大学医学会留学生全英文授课；参与大学生临床PBL示教；参与研究生儿科学教程的撰写和授课；参与规培生、进修医生的授课；参与儿科学试题集的编写；多次主办国家级继续教育学习班；接受消化专业医生的临床进修学习等。
科研：近五年承担了国家自然科学基金、上海市科委自然基金课题、上海市卫生局课题、“211”工程、小儿消化系统疾病横向课题等课题，主持参加有关“儿童幽门螺杆菌感染的多中心临床及基础研究”、“儿童早发型炎症性肠病的临床与基础研究”及“儿童克罗恩病的营养治疗的临床与基础研究”等。
