上海华山医院消化科成立于1964年，现为复旦大学消化疾病研究所所长单位和国家临床重点专科建设单位。同时也为华山医院分子与转化医学研究所疑难病例研究部主任单位。

科室拥有国家教育部“长江学者”奖励计划特聘教授1名；国家“杰出青年基金”获得者1名；国家人事部“新世纪百千万人才工程国家级人选”1名，国家教育部“新世纪优秀人才”资助计划1名，上海市“千人计划”1名，赛克勒中国医师“年度奖”获得者1名；复旦大学“特聘教授”1名，上海市“优秀学科带头人”1名，上海市“领军人才”1名。正、副教授9名，硕博导5名，设有博士后流动站。

针对消化系统常见和危急重症及疑难病，科室提供个体化、高质量临床医疗服务，在消化系肿瘤个体化治疗和各类疑难肝病诊治方面具有特色，另外，消化内镜介入治疗肿瘤也处于国内领先地位。先后承担各类科研项目近10余项，包括国家自然科学基金课题，国家科技部“863”及“973”课题等。

学科带头人刘杰教授为教育部“长江学者”奖励计划特聘教授、国家“杰出青年基金”获得者、复旦大学特聘教授、上海市领军人才、上海市优秀学科带头人。