湖南省儿童医院中西医结合科目前是省内最具有专科特色的科室，它是继承祖国传统医学、结合西医医疗理念的新型科室，科室坚持走临床与教学、科研相结合的道路，以中医及理疗技术为先导，以中西医结合服务为桥梁的专科特色。经过多年来的不懈努力，专业技术水平取得了较快的发展。科室有高级职称3人，中级职称3人，初级职称4人。

科室现拥有治疗仪器三十余台，在小儿疾病如：呼吸系统疾病、伤口、耳瘘并感染、麦粒肿、淋巴结炎、肛周脓肿、腹泻等疾病的理疗方面有独到之处，治疗效果明显；中西医结合治疗脑炎、脑积水、小儿脑瘫、智力低下、视神经萎缩、面瘫、偏瘫、臂丛神经损伤等独具特色，疗效显著；物理治疗配合独特推拿手法治疗小儿斜颈，疗效甚佳。最新购入的价格近50万的超级神经治疗仪和中药定向导入治疗仪，更是在小儿神经系统疾病治疗方面，有效率达到100%，在呼吸、消化系统疾病的治疗方面，治愈率高达90%以上。另开设的小儿推拿专科填补了湖南省小儿推拿特色治疗的空白，为一些难治性小儿疾病，开创了新的治疗途径。