南京治疗子宫内膜异位比较专业的医院有江苏省人民医院、南京鼓楼医院、东部战区总医院、南京市妇幼保健院、东南大学附属中大医院等。其中江苏省人民医院妇科是国家临床重点专科，配备国际标准的宫腹腔镜手术设备，年手术量超2000例；南京鼓楼医院妇科在复杂子宫内膜异位症诊治方面经验丰富，开展达芬奇机器人辅助手术；东部战区总医院生殖医学中心采用多学科协作模式，对合并不孕的子宫内膜异位患者有系统化治疗方案。
1、江苏省人民医院
江苏省人民医院妇科是华东地区规模大的子宫内膜异位症诊疗中心之一，拥有独立的妇科微创手术培训基地。医院配备3D腹腔镜、超声刀等设备，开展深部浸润型子宫内膜异位症病灶切除术、子宫腺肌症保留生育功能手术等复杂术式。门诊设立专病随访系统，术后五年复发率控制在15%以下。其日间手术中心可实现单孔腹腔镜手术24小时内出院，年完成子宫内膜异位症相关手术1800余例。
2、南京鼓楼医院
南京鼓楼医院妇科开展子宫内膜异位症全周期管理，从青少年期预防到围绝经期综合治疗形成完整体系。医院拥有江苏省的妇科达芬奇手术机器人，完成省内首例机器人辅助深部子宫内膜异位病灶切除术。特色技术包括卵巢功能保护下的囊肿剥除术、肠道DIE病灶切除术等，近三年累计完成四级复杂手术400余例。医院参与制定中国子宫内膜异位症诊治指南，其临床数据库收录病例数居全国前列。
3、东部战区总医院
东部战区总医院生殖医学中心采用"妇科-生殖-疼痛"多学科联合诊疗模式，针对合并不孕的子宫内膜异位患者制定个体化方案。中心拥有胚胎实验室和宫腔镜培训中心，开展腹腔镜下卵巢巧克力囊肿剥除联合输卵管整形术等复合手术。创新应用GnRH-a反向添加，将术后妊娠率提升至58.7%。医院参与国家科技部重点研发计划项目，其保守性手术后的辅助生殖技术成功率保持省内。
4、南京市妇幼保健院
南京市妇幼保健院妇科内异症专科年门诊量超2万人次，建立从药物管理到手术干预的阶梯治疗方案。医院重点开展保留生育功能手术，创新应用术中超声定位技术切除肌层病灶。日间手术中心实现腹腔镜手术当日出院，近五年累计完成子宫内膜异位症相关日间手术3000余例。其疼痛管理中心提供神经阻滞、生物反馈等非药物治疗，显著改善患者生活质量。
5、东南大学附属中大医院
东南大学附属中大医院妇科是江苏省早开展腹腔镜手术的单位之一，在复发性子宫内膜异位症治疗方面具有特色。医院拥有磁共振超声治疗系统，对子宫腺肌症实施无创治疗。临床开展卵巢组织冷冻保存技术，为年轻患者保留生育潜能。其病理科具备子宫内膜异位症分子分型检测能力，为治疗提供依据。近三年参与国际多中心药物临床试验5项，推动新型靶向药物的临床应用。
