南京治疗子宫内膜异位比较好的医院有江苏省人民医院、南京鼓楼医院、东南大学附属中大医院、南京市妇幼保健院、江苏省中医院、东部战区总医院、南京医科大学第二附属医院、南京市第一医院、江苏省中西医结合医院、南京同仁医院。其中江苏省人民医院、南京鼓楼医院和东南大学附属中大医院在妇科疾病诊疗领域具有较高声誉，设备且临床经验丰富。
1.江苏省人民医院
江苏省人民医院妇科是重点专科，子宫内膜异位症诊疗水平处于国内地位。医院配备高清腹腔镜、宫腔镜等设备，开展药物保守治疗、微创手术及综合管理方案。年接诊子宫内膜异位患者超2000例，建立了个体化治疗体系，尤其擅长复杂型深部浸润型子宫内膜异位的多学科联合手术。医院设有妇科内分泌实验室，可进行激素检测指导治疗。
2.南京鼓楼医院
南京鼓楼医院妇科为江苏省临床重点专科，在子宫内膜异位症诊治方面形成特色技术。医院拥有达芬奇手术机器人系统，开展保留生育功能的微创手术，术后复发率控制在较低水平。开设子宫内膜异位专病门诊，提供长期随访管理服务。近年开展超声、GnRH拮抗剂等新型治疗方式，参与多项国际多中心药物临床试验。
3.东南大学附属中大医院
东南大学附属中大医院妇科是南京市重点学科，子宫内膜异位症诊疗规范参照国际指南。医院采用腹腔镜联合超声刀技术，实现病灶切除。建立疼痛管理中心，针对不同分期的患者制定阶梯化治疗方案。开展卵巢功能保护技术，对合并不孕的患者实施生育力评估与干预。医院病理科可进行子宫内膜异位病灶的分子分型检测。
4.南京市妇幼保健院
南京市妇幼保健院妇科年完成子宫内膜异位手术1500余例，专科实力位居全市前列。医院重点开展保留子宫的保守性手术，建立术后药物维持治疗标准化流程。设有妇科疼痛门诊，采用神经阻滞等特色技术缓解顽固性疼痛。与生殖医学中心联动，为有生育需求的患者提供一体化诊疗方案。
5.江苏省中医院
江苏省中医院妇科中西医结合治疗子宫内膜异位症具有独特优势。除常规手术外，开发活血化瘀中药组方配合穴位贴敷、灌肠等外治法。建立"手术+中药+针灸"的三联，有效降低复发率。医院制剂室生产专科协定处方，开展雷火灸、督脉灸等特色技术改善盆腔微循环。
南京地区三甲医院均设有妇科专科，诊疗方案规范。患者可根据病情复杂程度、治疗需求以及医保政策等因素选择适合的医疗机构。建议首诊选择专科实力强的医院明确诊断，后续可结合中医调理或就近医院进行长期管理。所有推荐医院均开通网络预约和转诊绿色通道。
