南京治疗肾结石比较好的医院有江苏省人民医院、南京鼓楼医院、东部战区总医院、南京市第一医院、南京医科大学第二附属医院等。其中江苏省人民医院泌尿外科设备，拥有多台体外冲击波碎石机和高清腹腔镜系统，年手术量超过2000例；南京鼓楼医院结石专科开展24小时急诊碎石服务，配备新一代超声定位碎石设备；东部战区总医院采用多学科联合诊疗模式，在复杂肾结石处理方面具有丰富经验。
1、江苏省人民医院
江苏省人民医院泌尿外科是重点专科，设有独立的结石病区。科室拥有德国多尼尔DeltaII型体外碎石机、瑞士EMS超声气压弹道碎石机等设备，常规开展经皮肾镜取石术、输尿管软镜碎石术等微创手术。医院建立了结石成分分析实验室，能为患者提供个性化预防方案。近年来开展的无管化经皮肾镜技术，使患者术后恢复时间缩短30%。
2、南京鼓楼医院
南京鼓楼医院泌尿外科结石治疗中心配备有国内首台电磁式体外冲击波碎石机，可实现定位碎石。科室创新开展日间手术模式，简单结石患者24小时内即可完成入院到出院全过程。针对鹿角形结石等复杂病例，采用三维重建技术辅助手术规划，结石清除率达92%以上。医院还设有代谢评估门诊，为复发结石患者提供系统化防治服务。
3、东部战区总医院
东部战区总医院泌尿外科在军地融合医疗体系中具有突出优势，年完成各类结石手术1500余例。科室特色技术包括超声引导下微通道经皮肾镜术、输尿管软镜联合激光碎石术等，对合并解剖异常的复杂结石处理经验丰富。医院配备有新一代结石成分红外光谱分析仪，能精确检测结石成分。针对特殊职业人群开展的结石预防项目获得军队医疗成果奖。
4、南京市第一医院
南京市第一医院泌尿外科设有结石专病门诊，拥有全套德国狼牌内窥镜系统。科室在儿童结石诊治方面形成特色，配备有专门的小儿输尿管镜设备。创新开展的"一步法"经皮肾镜技术，将传统两期手术合并为单次完成。医院结石代谢评估中心可进行24小时尿液成分分析，为患者制定的饮食干预方案。
5、南京医科大学第二附属医院
南京医科大学第二附属医院泌尿外科是江苏省临床重点专科，结石亚专业组配备有钬激光碎石系统。科室在妊娠期结石的微创处理方面经验丰富，建立多学科协作机制确保母婴。开展的输尿管软镜日间手术模式，患者平均住院时间控制在18小时以内。医院还设有结石预防随访门诊，提供长期健康管理服务。
