根据2022年复旦版《中国医院专科声誉排行榜》，合肥市在脑科领域表现突出的医院包括：中国科学技术大学附属第一医院（安徽省立医院）神经内科（复旦排名全国第15位）、安徽医科大学第一附属医院神经外科（复旦排名华东区提名）。此外，安徽医科大学第二附属医院神经内科、合肥市第一人民医院神经内科、合肥市第二人民医院神经外科、安徽省第二人民医院神经内科、安徽省中西医结合医院脑病科、安徽省儿童医院神经内科、合肥市第三人民医院神经内科及安徽省精神卫生中心精神科，均为合肥市具备脑科诊疗能力的医疗机构。这些医院在神经疾病诊疗、科研创新及多学科协作方面均具有较高水平，为患者提供全面医疗服务。
1.中国科学技术大学附属第一医院（安徽省立医院）-神经内科
中国科学技术大学附属第一医院神经内科在复旦专科排行榜中位列全国第15位，是安徽省神经系统疾病诊疗中心。科室在脑血管病介入治疗、癫痫诊断及帕金森病综合管理领域处于省内地位，配备3.0T磁共振、数字减影血管造影（DSA）等设备，年接诊量超10万人次。其卒中中心通过国家脑防委认证，急性脑梗死静脉溶栓时间窗内救治率达95%以上。
中国科学技术大学附属第一医院地址：合肥市庐江路17号。
就诊科室：神经内科。
2.安徽医科大学第一附属医院-神经外科
安徽医科大学第一附属医院神经外科获复旦华东区专科声誉提名，是安徽省神经外科临床医学研究中心。科室在脑肿瘤显微手术、颅底内镜技术及功能神经外科（如难治性癫痫手术）方面具有显著优势，年均完成四级手术超2000台。其垂体瘤多学科诊疗团队采用经鼻蝶内镜技术，肿瘤全切率超过90%。
安徽医科大学第一附属医院地址：合肥市蜀山区绩溪路218号。
就诊科室：神经外科。
3.安徽医科大学第二附属医院-神经内科
安徽医科大学第二附属医院神经内科是安徽省脑卒中防治联盟成员单位，重点开展认知障碍疾病早期筛查及神经免疫性疾病诊疗。科室建立记忆门诊和神经电生理中心，依托脑脊液细胞学检测技术，对多发性硬化等疾病诊断准确率居省内前列。
安徽医科大学第二附属医院地址：合肥市经济技术开发区芙蓉路678号。
就诊科室：神经内科。
4.合肥市第一人民医院-神经内科
合肥市第一人民医院神经内科为合肥市医学重点学科，在脑卒中绿色通道建设及神经重症监护方面具有特色。科室联合康复医学科开展早期床边康复，降低卒中后致残率，其静脉溶栓数量连续三年居市级医院。
合肥市第一人民医院地址：合肥市淮河路390号。
就诊科室：神经内科。
5.合肥市第二人民医院-神经外科
合肥市第二人民医院神经外科是合肥市创伤救治中心核心科室，擅长重型颅脑损伤综合救治及高血压脑出血微创手术。采用立体定向穿刺技术治疗脑出血，手术创伤小，术后恢复快，患者平均住院时间缩短至7天。
合肥市第二人民医院地址：合肥市瑶海区和平路246号。
就诊科室：神经外科。
6.安徽省第二人民医院-神经内科
安徽省第二人民医院神经内科为省级工伤康复定点机构，神经变性病及神经康复领域。科室引进经颅磁刺激技术用于卒中后肢体功能恢复，结合中医针灸，显著提升患者生活质量。
安徽省第二人民医院地址：合肥市北二环砀山路1868号。
就诊科室：神经内科。
7.安徽省中西医结合医院-脑病科
安徽省中西医结合医院脑病科为国家中医药管理局重点专科，采用“中药+针灸+现代康复”模式治疗眩晕、失眠等疾病。其研发的“醒脑开窍针法”应用于脑梗死后意识障碍患者，达80%以上。
安徽省中西医结合医院地址：合肥市史河路45号。
就诊科室：脑病
