南京治疗肝癌专业水平较高的医院包括江苏省人民医院、东南大学附属中大医院、南京鼓楼医院、东部战区总医院、南京市第二医院、江苏省肿瘤医院、南京市第一医院、江苏省中医院等医疗机构。其中江苏省人民医院肝胆中心在肝癌性手术方面经验丰富，常规开展解剖性肝切除及射频消融术，五年生存率处于省内水平。东南大学附属中大医院介入科开展的载药微球栓塞术（DEB-TACE）可杀灭肿瘤细胞，其肿瘤中心实施的靶向-免疫联合治疗方案获得多项省级科研成果。南京鼓楼医院肝胆外科配备第四代达芬奇手术机器人系统，每年完成肝癌微创手术超400例，其肝癌分期系统被纳入国家诊疗规范。
江苏省人民医院
该院肝胆中心是国家临床重点专科，拥有独立肝癌MDT诊疗中心，配备3.0T磁共振引导超声系统。针对不同分期的肝癌患者，开展三维可视化手术规划、ALPPS分阶段肝切除术等前沿技术。在肝移植领域累计完成活体肝移植手术82例，移植患者五年生存率达71.3%。科室配备专用介入手术室，可同期进行TACE联合微波消融的序贯治疗，相关技术获江苏省医学新技术引进一等奖。
东南大学附属中大医院
医院肿瘤科为国家疑难病症诊治能力提升工程单位，建立肝癌生物样本库及基因检测平台。介入治疗科配备双平板DSA系统，开展的放射性粒子植入术对门静脉癌栓突破65%。临床研究方面，参与国际多中心药物临床试验12项，自主研发的载药纳米微粒栓塞剂已完成动物实验。医院设立的肝癌营养支持小组，通过人体成分分析仪为患者制定个体化营养方案，显著降低术后并发症发生率。
南京鼓楼医院
肝胆外科年手术量逾千例，在腹腔镜解剖性肝段切除术中应用吲哚菁绿荧光导航技术，微小病灶检出率提升至92%。建立的肝癌复发预测模型整合循环肿瘤DNA检测数据，准确率优于传统影像学评估。医院肿瘤科配置TOMO放射治疗系统，立体定向放疗（SBRT）对早期肝癌的局部控制率达89%。作为国家肝癌规范化诊疗质控试点单位，其肝癌诊疗路径被纳入华东地区医疗质量控制标准。
东部战区总医院
该院肿瘤放射治疗科配备速锋刀（EDGE）系统，针对肝癌肺转移病灶开展体部立体定向放疗，单次治疗剂量误差控制在0.3mm以内。建立的肝癌生物信息学分析平台，可对2000余个基因位点进行检测，指导个体化靶向药物选择。肝胆外科在复杂肝癌切除中应用超声乳化吸引刀（CUSA），术中出血量减少40%，重大手术并发症发生率低于3%。
南京市第二医院
作为江苏省传染病专科医院，在乙肝相关肝癌治疗方面形成特色优势。肝病科开展抗病毒治疗与肝癌介入联合治疗方案，使病毒抑制率提升至98%。肿瘤介入科应用载药微球联合免疫检查点抑制剂的新，客观缓解率较传统方案提高25个百分点。医院设立的肝癌患者全程管理平台，通过移动医疗系统实现术后随访、用药提醒等智能化服务。
