南京治疗食道癌比较好的医院有江苏省人民医院、南京鼓楼医院、江苏省肿瘤医院、东南大学附属中大医院、东部战区总医院。其中，江苏省人民医院肿瘤中心作为国家临床重点专科，在消化道肿瘤综合治疗领域具有显著优势；南京鼓楼医院肿瘤科配备有达芬奇机器人手术系统，可开展高精度微创手术；江苏省肿瘤医院作为省级专科医院，拥有国内的放射性粒子植入治疗技术。
江苏省人民医院
江苏省人民医院肿瘤中心针对食道癌建立了规范化诊疗体系，常规开展内镜黏膜下剥离术、胸腔镜食管切除术等微创技术。该院配置有容积旋转调强放疗系统，可实施放疗，降低对正常组织的损伤。在化疗方案制定中应用药物基因组学检测技术，提升用药性。医院与德国海德堡大学合作开展食管癌靶向治疗研究，参与多项国际多中心临床试验，可为患者提供新型治疗方案。
南京鼓楼医院
南京鼓楼医院肿瘤诊疗中心年完成食管癌手术逾500例，配备有电磁导航支气管镜系统，可定位微小病灶。医院建立的分子病理诊断平台能检测HER2、PD-L1等20余种生物标志物，为免疫治疗提供依据。该院在国内率先开展食管癌术后加速康复外科（ERAS）管理，通过营养支持、疼痛控制等综合措施，将平均住院日缩短至7天。其科研团队在食管癌淋巴结转移预测模型构建方面取得突破性进展。
江苏省肿瘤医院
江苏省肿瘤医院食管癌专病中心开展光动力治疗、射频消融等特色技术，针对晚期患者可进行放射性粒子支架置入术。医院拥有江苏质子治疗中心，对邻近重要器官的肿瘤可实施高精度放疗。在化疗耐药性研究领域，该院建立的患者源性肿瘤异种移植（PDX）模型库，为个体化用药提供实验依据。医院牵头制定《江苏省食管癌诊疗质量控制标准》，定期发布治疗质量监测报告。
东南大学附属中大医院
东南大学附属中大医院消化肿瘤中心应用超声内镜引导下细针穿刺技术，实现食管癌分期。该院引进的螺旋断层放射治疗系统（TOMO）可实施超长范围照射，适用于颈段食管癌治疗。在术后功能重建方面，创新采用空肠代食管术式，有效改善患者吞咽功能。医院建立的生物样本库累计收集食管癌组织标本2000余例，支撑多项国家自然科学基金研究项目。
东部战区总医院
东部战区总医院肿瘤放射治疗科配备有立体定向放射外科系统（CyberKnife），对复发或转移病灶实施单次大剂量照射。医院开展的食管癌新辅助化疗联合免疫治疗研究，使手术切除率提升至78%。其病理科应用二代测序技术进行全外显子组检测，可识别遗传性食管癌易感基因。针对放疗后食管狭窄问题，创新采用生物可降解支架植入技术，显著降低再狭窄发生率。
