北京治结肠癌知名的医院有中国医学科学院肿瘤医院、北京大学肿瘤医院、北京协和医院、中国人民解放军总医院（301医院）、首都医科大学附属北京友谊医院、北京医院、中日友好医院、首都医科大学附属北京朝阳医院、北京清华长庚医院。这些医院在结肠癌的诊断、治疗及科研方面均具有较高水平，部分医院还设有专门的结直肠肿瘤诊疗中心。
中国医学科学院肿瘤医院在肿瘤综合治疗领域处于国内地位，其结直肠外科拥有的微创手术技术和多学科协作诊疗模式。北京大学肿瘤医院胃肠肿瘤中心开展规范化诊疗，提供从早期筛查到晚期姑息治疗的全流程服务。北京协和医院普通外科在复杂结肠癌手术和综合治疗方面经验丰富，尤其擅长高龄患者和高难度病例的处理。
中国医学科学院肿瘤医院是国家癌症中心依托单位，其结直肠外科年手术量超过1500例。医院配备有达芬奇手术机器人、3D腹腔镜等设备，可开展保留功能的微创手术。特色技术包括经自然腔道取标本手术（NOSES）、低位直肠癌保肛手术等。医院参与制定多项国家结直肠癌诊疗规范，开展国际多中心临床试验，为患者提供新治疗方案。日间手术中心和加速康复外科流程显著缩短住院时间，五年生存率数据达到国际水平。
北京大学肿瘤医院胃肠肿瘤中心实行多学科联合诊疗模式，每周组织外科、内科、放疗科等多学科会诊。医院拥有国内结直肠癌肝转移专病病房，开展同步切除原发灶和转移灶的联合手术。特色技术包括荧光导航淋巴结清扫、术中放疗等。医院建立从内镜筛查到术后随访的全程管理体系，提供遗传性结直肠癌的基因检测和家族风险评估服务。日间化疗病房和疼痛管理团队有效改善患者生活质量，参与多项国际新药临床试验。
北京协和医院普通外科在复杂结肠癌手术方面具有技术优势，可完成合并心肺疾病的高危患者手术。医院开展全结肠系膜切除术（CME）、侧方淋巴结清扫等规范术式，建立术后快速康复流程。消化内科拥有高清晰度电子染色内镜系统，可发现早期微小病变。医院设有营养支持团队和造口护理门诊，为术后患者提供专业指导。作为国家疑难病症诊治能力提升工程项目单位，接收来自全国的转诊病例，在罕见类型结肠癌诊治方面积累丰富经验。
中国人民解放军总医院普通外科医学部开展机器人辅助结肠癌术，手术精度高、创伤小。医院拥有复合手术室，可同期处理合并血管侵犯的复杂病例。特色技术包括术中肠镜检查定位、预防性回肠造口等。医院参与军队特殊人群结直肠癌筛查项目，建立数字化手术教学系统。康复医学科提供术后盆底功能训练，消化内科开展内镜下黏膜剥离术（ESD）治疗早癌。
首都医科大学附属北京友谊医院普外科在结肠癌腹腔镜手术方面经验丰富，年手术量逾800例。医院开展经肛全直肠系膜切除术（TaTME）等新技术，建立规范的淋巴结清扫标准。消化疾病中心配备超声内镜和放大内镜，提高早期诊断率。医院设有临床营养科和心理咨询室，实施围手术期全程管理。作为北京市消化疾病研究所依托单位，在炎症性肠病相关结肠癌研究方面具有特色。
