对男性不育应作体格检查，一般检查包括身高、体重，两手平时伸指距离，观察二性征的发展情况，如胡须、喉结、腋毛、毛发的生长，是否有男性乳房发育等。重点检查泌尿生殖系统。尿道下裂有无睾丸大小，质地柔软坚硬。触诊无增厚，触痛，囊肿。观察输精管和精索静脉。需要时，肛诊检查前列腺的大小，质地，并作前列腺液化验。
男人不育应该做精液检查：是判断男人生育能力的一种重要方法。注意精液标本的采集，在10~30分钟后液化后再作常规检查，肉眼观察颜色、数量及ph值，镜下观察精子密度、活力、活率及形态学等，精液中包括果糖、微量元素等生化分析，并根据具体需要作各种相关检查。
对严重缺精或无精的患者，可进行内分泌激素检测、药物检测、染色体检查，必要时进行输精管造影及睾丸活检等。
有无创伤性男性不孕的物理诊断方法，主要有多普勒超声听诊器诊断血管病变、阴囊测温仪诊断精索静脉曲张、心电图和MRI诊断性器官结构异常。
目前临床应用的方法是睾丸活检、输精管造影、间质细胞功能检查、宫颈粘液试验、穿刺去透明带田鼠卵子试验、免疫学试验、精子活力测定、细菌学检查等。
