对男性不育应作体格检查，一般检查包括身高、体重，两手平时伸指距离，观察二性征的发展情况，如胡须、喉结、腋毛、阴毛的生长，是否男性乳房发育等。重点检查泌尿生殖系统。尿道下裂，睾丸大小，质地柔软。触诊无增厚，触痛，囊肿。观察输精管和精索静脉。根据需要时肛诊检查前列腺的大小、质地，检出前列腺液化验。
对男性不育应做检查：是判断男性生育能力的重要手段。注意采集标本，待10~30分钟完全液化后再作常规检查，包括肉眼观察颜色、数量和ph值；在显微镜下观察密度、活力和活动性，以及生物化学分析，包括果糖、微量元素等，各种相关的检验应根据特殊需要进行。
另外，对于严重的少精症患者，还需要做内分泌激素检测，药物测试，染色体检查，必要时做输精管造影，睾丸活检等等。
有无创伤性男性不孕的物理诊断方法，主要有多普勒超声听诊器诊断血管病变、阴囊测温仪诊断精索静脉曲张、心电图和MRI诊断性器官结构异常。
对男性不孕症的进一步检查诊断方法，目前临床应用的有：睾丸活检，输精管造影，间质细胞功能检测，曲细精管功能检测，宫颈粘液检测，透透带田鼠卵子检测，免疫检测，活力检测，细菌检测。
