南京好的治疗癫痫的医院排名是：南京脑科医院、南京鼓楼医院、江苏省人民医院、南京大学医学院附属金陵医院、东南大学附属中大医院。
第一名：南京脑科医院
南京脑科医院，又名南京医科大学附属脑科医院，江苏省精神卫生中心，始建于1947年，是我国早的国立脑医学专科医院。南京市胸科医院始建于1950年，具有胸部疾病诊疗专科特色。2018年6月26日，南京市整合南京脑科医院与南京市胸科医院资源，成为新的南京脑科医院，一院两区。
目前医院拥有员工近2200人，床位近2000张，有精神科、神经内科、神经外科、呼吸科、胸外科、心血管内科、儿童心理卫生研究中心、医学心理科、老年医学科、康复医学科等42个临床科室，承担着南京市、江苏省乃至全国神经、精神、胸部疾病的医疗、康复、预防、教学、科研和司法鉴定等任务，同时承担着相关政府指令性工作及突发应急事件的心理救援等处置任务，在国家重大城市任务和突发公共卫生事件处置中发挥社会维稳作用。
第二名：南京鼓楼医院
南京鼓楼医院(南京大学医学院附属鼓楼医院)，建于1892年，为中国早的西医院之一。自新中国成立到改革开放初期，鼓楼医院医教研管各方面取得快速发展，目前已发展成为学科门类齐全、师资力量雄厚、医疗技术、科研实力较强的大型研究型综合性三级甲等医院。目前床位3800张，在岗职工5000余人。重点学科方面
医院不断深化学科内涵，培育和新建了一大批重点专(学)科。其中国家重点学科、国家临床重点专科9个，省临床医学中心3个、省医学重点学科7个、省医学创新团队4个、省级临床重点专科29个、省级质控中心9个、省专科(专病)诊疗中心8个，市临床医学中心9个、市重点专科31个。医院在2019年复旦综合医院排行榜中排名第37位，其中风湿免疫科全国第4位，生殖医学科全国第6位，内分泌科、整形烧伤科、骨科、麻醉手术科、消化科、药学部获得全国提名，且排名均位于全省前列。
第三名：江苏省人民医院
江苏省人民医院，暨南京医科大学第一附属医院、江苏省临床医学研究院、江苏省红十字医院。江苏省妇幼保健院作为江苏省人民医院妇幼分院，实行一体化管理。
医院是国家重大疫情救治基地、国家(江苏)紧急医学救援队承建单位，承担国家疑难病症诊治能力提升工程建设项目。现有国家重点学科1个,国家临床重点专科19个;省临床医学研究中心5个,江苏高校优势学科1个,省重点学科2个,省“国家重点学科”培育建设点1个,省“科教强卫”工程临床医学中心4个、医学重点学科(实验室)13个，省级医疗诊治中心5个，省级专科(病)诊疗中心8个,省级临床重点专科34个。
第四名：南京大学医学院附属金陵医院
东部战区总医院组建于2018年11月，以原南京军区南京总医院、原第八十一医院(含八十六临床部)、原第八十二医院(含一四九临床部)、原第三五九医院为基础，纳入驻宁及周边地区机关院校15家门诊部。
医院现拥有国家、军队、军区和江苏省重点学科34个。拥有2名中国工程院院士、1名长江学者、4名百千万人才工程人选。先后有49人获得政府特殊津贴，17人次获得"何梁何利奖""国家突出贡献中青年专家""国家杰出青年基金"等重大奖项。
第五名：东南大学附属中大医院
东南大学附属中大医院始建于1935年，其前身为中央大学医学院附设医院，历经第五军医大学附属医院，解放军84医院及南京铁道医学院附属医院等几个重要历史阶段。历史上名家辈出，戚寿南、姜泗长、张涤生、牟善初、阴毓璋、王士雯、贺林、杨焕明等众多院士和专家学者曾在此校园求学或执教，奠定了丰厚的文化底蕴和笃学重研的传统。经过87年的发展，现已成为集医疗、教学、科研为一体的大型综合性教学医院，是教育部直属的国家“双”A类、“985工程”、“211工程”重点建设大学附属医院，也是江苏省首批通过卫生部评审的综合性三级甲等医院。
