北京治疗肝癌比较好的医院有北京协和医院、中国人民解放军总医院（301医院）、北京大学肿瘤医院、中国医学科学院肿瘤医院、首都医科大学附属北京佑安医院。其中北京协和医院在肝癌综合治疗方面经验丰富，拥有的诊疗设备；中国人民解放军总医院肝胆外科实力雄厚，开展各类复杂肝癌手术；北京大学肿瘤医院在肝癌治疗领域具有特色优势。
北京协和医院肝胆外科是国家重点学科，年肝癌手术量超过500例。医院配备达芬奇手术机器人、三维可视化手术规划系统等设备，可开展解剖性肝切除、ALPPS等复杂术式。特色诊疗包括多学科联合门诊、转化治疗策略，对中晚期肝癌患者开展系统化综合治疗。该院参与制定多项肝癌诊疗指南，临床研究成果发表于国际期刊。
解放军总医院肝胆胰外科医学部在肝癌微创治疗领域保持，腹腔镜肝切除手术占比达65%以上。医院拥有亚洲肝胆外科机器人培训中心，开展荧光导航肝切除、联合肝脏分隔和门静脉结扎的二步肝切除术等前沿技术。日间手术中心可实现部分小肝癌患者48小时内完成入院-手术-出院全流程。
北京大学肿瘤医院肝胆胰外科以肝癌个体化治疗为特色，建立基于基因检测的用药体系。医院设有专门的肝癌介入治疗中心，年完成TACE、消融等介入手术2000余例。参与国际多中心临床试验数量居全国前列，提供包括靶向治疗、免疫治疗在内的十余种创新治疗方案。PET-MRI融合影像系统可检出早期微小肝癌病灶。
中国医学科学院肿瘤医院是国家癌症中心依托单位，肝癌五年生存率高于全国平均水平15%。医院首创"肝癌全程管理"模式，从早期筛查到终末期关怀形成完整诊疗链条。拥有国内肝癌生物样本库，为临床研究提供重要支撑。质子治疗中心可对特殊位置肝癌实施精确放疗，保护正常肝组织。
北京佑安医院作为传染病专科医院，在乙肝相关肝癌诊治方面独具优势。医院建立肝癌早筛早诊体系，通过FibroScan、液体活检等技术实现肝硬化患者监测。多学科协作团队可同时处理肝癌合并HIV、HCV等复杂病例。中西医结合治疗中心提供特色保肝方案，减轻放化疗。
