南昌地区有多家医院在男科疾病治疗方面具有丰富的临床经验和专业优势。南昌大学第一附属医院泌尿外科是国家临床重点专科，年门诊量超过10万人次。江西省人民医院泌尿外科拥有独立的男科诊疗中心，配备国际的诊疗设备。南昌市第三医院泌尿外科在男性不育症治疗方面具有特色。南昌市第九医院泌尿外科在慢性前列腺炎综合治疗方面经验丰富。江西省中医院男科采用中西医结合方法治疗男性功能障碍。
1.南昌大学第一附属医院
该院泌尿外科是国家临床重点专科建设项目，设有独立的男科门诊。拥有达芬奇手术机器人、钬激光等设备，年开展各类男科手术3000余例。在男性不育症显微外科手术、阴茎假体植入术等方面处于省内水平。科室发表SCI论文20余篇，获国家自然科学基金项目5项。
2.江西省人民医院
医院泌尿外科男科中心配备有精液分析仪、阴茎血流多普勒等专业设备。开展阴茎弯曲矫正术、精索静脉曲张显微结扎术等特色手术。在男性性功能障碍的规范化诊疗方面形成特色，建立了一套完整的诊疗流程。年接诊男科患者约2万人次。
3.南昌市第三医院
该院泌尿外科在男性不育症诊疗方面具有优势，开展睾丸穿刺取精、显微输精管吻合等手术。拥有全套精液分析系统和精子功能检测设备。科室与生殖医学中心合作，为不育患者提供一体化诊疗服务。近三年累计完成男性不育手术500余例。
4.南昌市第九医院
医院泌尿外科在慢性前列腺炎的综合治疗方面经验丰富，采用药物、物理、心理等综合治疗方法。配备前列腺治疗仪、微波治疗仪等设备。建立慢性前列腺炎专病门诊，年接诊患者8000余人次。开展多项前列腺炎相关临床研究。
5.江西省中医院
医院男科采用中西医结合方法治疗男性疾病，尤其在男性功能障碍治疗方面具有特色。开发了多种院内制剂，配合针灸、艾灸等传统。拥有男性功能检测室和中医特色治疗室。年门诊量约1.2万人次，中药使用率达85%以上。
