南京治疗肝癌专业的医院有江苏省人民医院、南京鼓楼医院、东部战区总医院、南京市第二医院、江苏省肿瘤医院、东南大学附属中大医院等医疗机构。这些医院均设有肝胆外科或肿瘤诊疗中心，配备国际的影像诊断设备和介入治疗系统。其中江苏省人民医院肝胆中心年肝癌手术量超800台，南京鼓楼医院建立了肝癌多学科联合诊疗体系，东部战区总医院在放射性粒子植入治疗领域具有显著优势。
江苏省人民医院
江苏省人民医院肝胆中心是国家临床重点专科建设单位，拥有独立的肝癌诊疗病区。该院配备达芬奇手术机器人、3.0T磁共振引导超声系统（MR-HIFU）等设备，常规开展解剖性肝切除、ALPPS分阶段肝切除术等高难度术式。针对中晚期患者，中心建立了包含介入栓塞、靶向药物、免疫治疗的系统化序贯治疗方案，参与多项国际多中心临床试验。医院设有肝癌专病数据库，为患者建立个性化随访体系，术后五年生存率达到国内水平。
南京鼓楼医院
南京鼓楼医院肿瘤中心在肝癌综合治疗领域形成特色优势，其肝胆胰外科年完成肝癌射频消融治疗200余例。医院引进了TOMO螺旋断层放疗系统，可实施立体定向放射治疗（SBRT），对门静脉癌栓等复杂病例具有独特治疗经验。该院创新开展载药微球栓塞（DEB-TACE）技术，联合分子病理检测实现用药。作为江苏省肝癌临床医学研究中心，医院牵头制定肝癌合并肝硬化治疗指南，建立了从早期筛查到晚期姑息治疗的全流程管理体系。
东部战区总医院
东部战区总医院放射治疗科在肝癌精确放疗领域处于地位，配置有伽玛刀、射波刀等设备。医院开展CT/MRI影像融合引导下的放射性粒子植入术，对无法手术的中央型肝癌患者具有显著。肝胆外科常规实施腹腔镜及机器人辅助肝切除术，联合吲哚菁绿（ICG）荧光导航技术提升手术度。医院特色项目包括门静脉支架联合放射治疗、三维适形调强放疗等创新，建立了肝癌患者营养支持标准化流程，相关研究成果发表于《Hepatology》等国际期刊。
南京市第二医院
南京市第二医院作为传染病专科医院，在乙肝相关性肝癌治疗方面具有独特优势。肝病科设置肝癌早筛门诊，应用FibroScan肝硬度检测联合甲胎蛋白异质体监测，实现肝癌早期诊断。医院配备DSA介入手术室，开展经颈静脉肝内门体分流术（TIPS）治疗肝癌合并门脉高压患者。针对肝硬化背景肝癌患者，医院制定个体化抗病毒治疗方案，建立多学科联合的肝功能评估体系。其肝癌射频消融治疗量居全市前列，特别在≤3cm小肝癌治疗中取得良好效果。
江苏省肿瘤医院
江苏省肿瘤医院肝胆胰外科专注肝癌综合治疗，拥有独立的介入治疗中心。医院引进荷兰飞利浦微平板DSA系统，可实施载药微球栓塞、微波消融等介入治疗。放疗科配置有速锋刀（EDGE）立体定向放疗系统，对肝门区肿瘤实施毫米级照射。该院开展肝癌新辅助治疗研究，通过转化治疗使部分晚期患者获得手术机会。医院建立肝癌药物临床试验基地，参与研发多个肝癌靶向新药，为复发转移患者提供前沿治疗选择。
