南京治疗乳腺癌比较突出的医院包括江苏省人民医院（南京医科大学第一附属医院）、江苏省肿瘤医院、南京鼓楼医院、东南大学附属中大医院以及南京市第一医院。这三甲医院在乳腺癌综合诊疗领域均具备诊疗资质，其中江苏省人民医院乳腺疾病诊疗中心年接诊量超2万人次，江苏省肿瘤医院乳腺癌5年生存率居全省前列，南京鼓楼医院开展的保乳手术比例达40%以上。
江苏省人民医院（南京医科大学第一附属医院）
该院乳腺疾病诊疗中心配备有数字化乳腺X线摄影系统、3.0T磁共振等设备，常规开展超声引导下真空辅助旋切活检、前哨淋巴结活检等诊断技术。在治疗方面实施个体化多学科诊疗模式，针对不同分期的乳腺癌患者制定手术、化疗、放疗、靶向治疗及内分泌治疗的综合方案。其自主研发的乳腺癌新辅助化疗方案被纳入《中国抗癌协会乳腺癌诊治指南》，开展的乳房重建手术包含假体植入、背阔肌皮瓣等多种术式选择。医院参与国家癌症中心牵头的乳腺癌临床研究项目，近三年在《BreastCancerResearch》等期刊发表SCI论文28篇。
江苏省肿瘤医院
作为省级肿瘤专科医院，该院乳腺外科年手术量逾1500台，其中保乳手术占比35%，乳房重建手术成功率达98%。配备有容积旋转调强放疗（VMAT）设备和术中放疗系统，可实施放射治疗。药学部开展治疗药物浓度监测，确保化疗方案的有效。医院建有省内乳腺癌生物样本库，储存样本量超2万份，支持分子分型指导下的治疗。其主导的"乳腺癌骨转移综合治疗研究"获江苏省科技进步二等奖，参与制定的《乳腺癌骨转移专家共识》在全国推广应用。临床试验中心开展CDK4/6抑制剂等20余项新药临床研究。
南京鼓楼医院
该院普外科乳腺专业组率先在华东地区开展乳腺微创旋切手术，年完成微创手术800余例。配备有全数字化乳腺导管镜系统，可精确诊断乳头溢液性疾病。创新开展的腔镜辅助下腋窝淋巴结清扫术，将手术创伤减少40%。肿瘤科引进美国TrueBeam直线加速器，可实施呼吸门控放疗技术。医院与南京大学合作建立的肿瘤分子诊断实验室，常规开展21基因检测等分子诊断项目。其"乳腺癌全程管理项目"建立患者电子健康档案系统，实现从筛查、治疗到随访的全周期管理，该项目入选国家卫健委改善医疗服务典型案例。
东南大学附属中大医院
该院乳腺病诊治中心配备有乳腺专用PET-CT和自动乳腺超声系统，开展的乳腺癌新辅助化疗完全缓解率（pCR）达32%。创新应用射频消融技术处理早期乳腺癌，保留乳房外观完整。放疗科配备有TOMO放射治疗系统，可实施乳腺动态调强放疗。医院研发的乳腺癌风险预测模型整合了遗传学、影像学和临床数据，预测准确率达85%。其参与的"中国乳腺癌筛查多中心研究"成果被写入国家癌症筛查技术规范。
南京市第一医院
该院乳腺外科常规开展乳腔镜手术和隐匿性乳腺癌定位技术，年完成乳腺癌手术600余例。肿瘤中心配备有荷兰核通后装治疗系统，可实施组织间插植放疗。医院自主开发的乳腺癌患者营养支持方案，有效降低化疗相关并发症发生率35%。其乳腺癌康复中心配备有淋巴水肿综合治疗仪等专业设备，开展术后功能康复训练和心理干预服务。医院牵头成立的"南京乳腺癌防治联盟"覆盖32家基层医疗机构，建立双向转诊绿色通道，年完成乳腺癌筛查3.2万人次。
