南京治疗食道癌较为正规且综合实力突出的医院包括江苏省人民医院、江苏省肿瘤医院、南京鼓楼医院、东部战区总医院以及东南大学附属中大医院。这些医院均配备现代化诊疗设备，设有胸外科、肿瘤内科、放疗科等核心科室，形成多学科联合诊疗体系。其中江苏省人民医院依托国家临床重点专科开展个体化治疗，江苏省肿瘤医院在放射治疗领域具有显著优势，南京鼓楼医院则率先开展达芬奇机器人手术等微创技术。
江苏省人民医院
江苏省人民医院（南京医科大学第一附属医院）作为省级三甲综合医院，其胸外科年完成食道癌手术超300例，常规开展胸腹腔镜联合食管癌术等四级手术。医院配备达芬奇手术机器人系统、3D胸腔镜等设备，联合放疗科开展术前新辅助治疗，病理科实现分子分型检测。针对中晚期患者，肿瘤科牵头组织多学科会诊，制定包含免疫治疗、靶向药物在内的综合治疗方案。院内设有临床试验中心，可为复发转移患者提供PD-1抑制剂等新型。
江苏省肿瘤医院
江苏省肿瘤医院（南京医科大学附属肿瘤医院）作为华东地区肿瘤专科医院，放疗中心拥有TOMO螺旋断层放疗系统、TrueBeam直线加速器等高端设备，可实施调强放疗、影像引导放疗等技术。胸外科建立从内镜筛查到术后康复的全流程管理体系，常规开展颈胸腹三切口食管切除术。该院参与制定《中国食管癌放射治疗指南》，在放射性食管炎防治、同步放化疗方案优化等方面形成特色。药物临床试验病房已开展20余项食管癌相关临床研究。
南京鼓楼医院
南京鼓楼医院胸外科年食管癌手术量突破400例，微创手术占比达65%以上。创新应用单孔胸腔镜联合腹腔镜技术，在完整切除肿瘤的同时保留喉返神经功能。配备超声内镜、窄带成像内镜等检查设备，实现早期病变诊断。放疗科开展立体定向放射治疗（SBRT），对不适合手术的早期患者实施性放疗。医院设立营养支持团队，针对吞咽困难患者制定个性化肠内营养方案，术后并发症发生率低于行业平均水平。
东部战区总医院
东部战区总医院肿瘤放射治疗科配置VarianHalcyon直线加速器，可实现4D-CT定位下的自适应放疗。胸外科开展全腔镜Ivor-Lewis手术，结合术中快速冰冻病理确保切缘阴性。消化内科运用共激光显微内镜技术，提升早期癌前病变检出率。医院与中科院合作建立肿瘤生物样本库，开展循环肿瘤DNA检测指导术后监测。放疗科针对局部晚期患者首创"三明治"式放化疗方案，五年生存率提高12%。
东南大学附属中大医院
东南大学附属中大医院胸外科建立食管癌数据库，运用人工智能分析手术预后相关因素。开展经纵隔镜食管切除术，避免传统开胸手术创伤。放疗科配置Monaco治疗计划系统，实施容积旋转调强放疗（VMAT）。医院设立吞咽功能康复中心，采用球囊扩张术、电刺激改善术后吞咽障碍。肿瘤介入科开展放射性粒子植入术，为无法手术患者提供局部控制方案。临床药理基地已完成食管癌新药临床试验7项，涉及EGFR抑制剂等靶向药物。
