在南京治疗肝癌比较好的医院有江苏省人民医院、南京鼓楼医院、东南大学附属中大医院、南京市第二医院和江苏省肿瘤医院。这些医疗机构均设有专业的肝胆疾病诊疗中心，配备国际的医疗设备，能够开展肝癌手术、介入治疗、靶向治疗等综合诊疗服务。其中江苏省人民医院肝胆中心年肝癌手术量超500例，南京鼓楼医院肝胆外科拥有达芬奇手术机器人系统，东南大学附属中大医院介入科在肝癌微创治疗领域技术突出。
江苏省人民医院
江苏省人民医院肝胆中心是国家临床重点专科，设有肝癌多学科联合诊疗（MDT）中心。该院配备3.0T磁共振、256排螺旋CT等影像设备，可开展肝切除术、腹腔镜肝肿瘤切除术等微创手术。在肝癌综合治疗方面，建立了射频消融联合靶向药物治疗体系，参与多项国际多中心新药临床试验。科室设有日间化疗病房，提供个性化随访管理系统，年完成肝癌介入手术超800台次。2021年通过JCI国际医疗认证，建立了肝癌患者全程管理模式。
南京鼓楼医院
南京鼓楼医院肝胆外科是江苏省肝胆外科疾病诊疗中心，拥有达芬奇机器人手术系统和术中超声导航系统。该院开展解剖性肝段切除术、ALPPS分阶段肝切除等复杂手术，针对中晚期肝癌建立经肝动脉化疗栓塞（TACE）联合免疫治疗的序贯治疗方案。医院建有生物样本库和肝癌数据库，与德国海德堡大学医院建立联合实验室，在肝癌分子分型研究领域取得多项专利。年完成肝癌肝移植手术约30例，术后5年生存率达国内水平。
东南大学附属中大医院
东南大学附属中大医院介入治疗科在肝癌微创治疗领域具有显著优势，拥有双平板DSA复合手术室。开展载药微球栓塞、放射性粒子植入等特色技术，针对门静脉癌栓患者实施经皮门静脉支架联合125I粒子条植入术。医院建立肝癌全程信息化管理系统，整合影像云平台实现多院区数据共享。在肝癌合并肝硬化治疗方面，开展经颈静脉肝内门体分流术（TIPS）联合靶向治疗的综合方案，相关研究成果发表于《Radiology》等国际期刊。
南京市第二医院
南京市第二医院肝病科专注肝癌合并病毒性肝炎的综合治疗，设有肝癌早筛门诊。应用FibroScan、肝癌特异性标志物检测等筛查技术，建立肝癌风险预测模型。在肝癌抗病毒治疗领域，开展核苷类药物联合PD-1抑制剂的临床研究。医院配备微波消融治疗系统，针对3cm以下肝癌病灶实施超声引导下消融，年完成消融治疗200余例。建有肝癌患者营养支持中心，提供个体化膳食指导方案。
江苏省肿瘤医院
江苏省肿瘤医院肝胆胰外科重点开展肝癌放射治疗，拥有TOMO螺旋断层放疗系统和射波刀。针对不可切除肝癌，实施立体定向放射治疗（SBRT）联合系统化疗的三联方案。医院参与制定《中国肝癌放疗指南》，在放射性肝损伤防护领域形成特色技术。设有临床试验中心，开展CAR-T细胞治疗、溶瘤病毒等前沿的临床研究。建立癌痛规范化治疗示范病房，为晚期肝癌患者提供多模式镇痛服务。
