南京治疗灰指甲比较好的医院有江苏省人民医院、东南大学附属中大医院、南京市第一医院、南京鼓楼医院、江苏省中医院等。其中，江苏省人民医院皮肤科在真菌感染治疗方面经验丰富，设备；东南大学附属中大医院皮肤科在灰指甲的诊断和治疗上具有较高的专业水平；南京市第一医院皮肤科则以其综合治疗手段和个性化方案受到患者认可。
1、江苏省人民医院
江苏省人民医院皮肤科是江苏省重点学科，在灰指甲等真菌性皮肤病治疗领域具有显著优势。医院配备的真菌检测实验室，能够快速准确诊断灰指甲类型。治疗方面采用药物口服、外用及物理治疗相结合的综合方案，针对不同类型和严重程度的灰指甲制定个性化治疗计划。医院还开展光动力治疗等新技术，为顽固性灰指甲患者提供更多选择。
2、东南大学附属中大医院
东南大学附属中大医院皮肤科在灰指甲治疗方面积累了丰富临床经验。科室拥有专业的真菌检测设备，能够准确鉴定致病菌种。治疗上采用系统用药与局部处理相结合的方式，注重药物性监测。对于严重病例，医院提供激光治疗等辅助手段，提高率。医院还建立了完善的随访制度，确保治果持久稳定。
3、南京市第一医院
南京市第一医院皮肤科在灰指甲诊疗方面形成了特色优势。医院采用国际标准的真菌培养和药敏试验，为用药提供依据。治疗上结合患者具体情况，制定分阶段治疗方案，既考虑又注重减少药物。医院还开展健康宣教，指导患者正确护理指甲，预防复发。对于特殊人群如孕妇、儿童等，科室有专门的治疗方案。
4、南京鼓楼医院
南京鼓楼医院皮肤科在灰指甲治疗方面具有较强实力。医院引进了的分子生物学检测技术，提高了诊断准确性。治疗上采用中西医结合方法，既有规范的抗真菌药物治疗，也配合中药浸泡等辅助。医院特别注重治疗过程中的指甲护理指导，帮助患者建立正确的日常护理习惯，减少交叉感染机会。
5、江苏省中医院
江苏省中医院在灰指甲治疗方面突出中医药特色。医院开发了多种中药外用制剂，配合现代抗真菌药物使用，既提高又降低。治疗上注重整体调理，通过改善患者体质来增强抗真菌能力。医院还提供中药浸泡、熏蒸等传统，为不愿长期服用西药的患者提供替代选择。对于反复发作的病例，医院有独特的治疗方案。
