南京治疗角膜炎比较好的专科医院有江苏省人民医院眼科、南京鼓楼医院眼科、南京市第一医院眼科、东南大学附属中大医院眼科、南京医科大学第二附属医院眼科等。其中江苏省人民医院眼科作为全省眼科诊疗中心，拥有独立的角膜病专科门诊，配备角膜共显微镜等设备；南京鼓楼医院眼科年角膜移植手术量居华东地区前列，开展各类感染性角膜炎的治疗；南京市第一医院眼科设有24小时角膜急诊绿色通道，对真菌性角膜炎等急重症具有丰富救治经验。
1、江苏省人民医院眼科
江苏省人民医院眼科是江苏省临床重点专科，角膜病亚专科配备德国OCULUS角膜地形图仪、前段OCT等全套检查设备。针对细菌性、病毒性、真菌性等各类角膜炎开展病原学检测和靶向治疗，常规开展角膜胶原交联术治疗难治性角膜炎。该科室与眼库建立长期合作，可为角膜溃疡穿孔患者及时提供移植材料，近年开展的新型治疗性角膜接触镜技术显著提升了重症患者的视力预后。
2、南京鼓楼医院眼科
南京鼓楼医院眼科为国家重点学科培育点，角膜病专业组拥有独立的层流洁净手术室。在感染性角膜炎诊疗方面，采用共显微镜活体检查技术，实现阿米巴性角膜炎的早期确诊。对于药物治疗无效的病例，开展深板层角膜移植、角膜内皮移植等个性化手术方案，术后视觉质量评估体系完善。科室建立的角膜病原体基因检测平台，显著提高了罕见病原体的检出率。
3、南京市第一医院眼科
南京市第一医院眼科为南京市医学重点学科，角膜病诊疗中心配备眼前节照相系统、角膜内皮细胞计数仪等设备。在重症角膜炎救治方面形成特色，对合并前房积脓的细菌性角膜炎实施急诊前房冲洗联合药物治疗方案。针对特殊类型角膜炎，开展角膜基质内注射、羊膜移植等特色治疗，建立的角膜病临床数据库为个体化治疗提供支持。科室参与制定的《感染性角膜炎诊疗专家共识》在全国推广应用。
4、东南大学附属中大医院眼科
东南大学附属中大医院眼科设有角膜与眼表疾病专科，引进法国角膜生物力学分析仪等设备。在免疫性角膜炎诊疗方面具有优势，建立阶梯式治疗方案，对蚕食性角膜溃疡等疾病采用免疫调节联合手术治疗。科室开展的角膜神经形态学评估技术，为神经营养性角膜炎的早期干预提供依据，近年参与多项角膜病相关临床研究项目。
5、南京医科大学第二附属医院眼科
南京医科大学第二附属医院眼科为江苏省住院医师规范化培训基地，角膜病专业组配备全套微生物检测实验室。在儿童角膜炎诊疗方面经验丰富，建立无创检查流程和儿童专用给药方案。针对角膜外伤后继发感染病例，采用3D打印技术定制治疗性角膜接触镜，开展的角膜交联技术有效控制感染灶扩散。科室定期举办角膜病健康教育活动，提升患者自我管理能力。
