杭州治疗自闭症比较专业的医院有浙江大学医学院附属儿童医院、杭州市第七人民医院、浙江省立同德医院、杭州市第一人民医院、杭州市儿童医院。这些医院在自闭症诊断、干预和康复方面具备丰富的临床经验，提供多学科协作的综合治疗方案。
1.浙江大学医学院附属儿童医院
浙江大学医学院附属儿童医院发育行为科是浙江省儿童自闭症诊疗核心机构，拥有标准化评估体系和个性化干预方案。医院配备Gesell发育量表、ADOS评估工具等国际认证诊断设备，开展应用行为分析、结构化教学等循证干预方法。门诊实行"评估-诊断-干预"一体化服务模式，年接诊自闭症患儿超2000例，建立从早期筛查到学龄期转衔的全程管理机制。医院同时承担国家自然科学基金自闭症相关课题研究，临床与科研结合紧密。
2.杭州市第七人民医院
杭州市第七人民医院儿童心理科开设自闭症专病门诊，采用医教结合模式开展康复训练。医院引进PEERS社交技能训练、地板时光等国际干预技术，配备感觉统合训练室、多媒体互动教室等专业场地。针对不同年龄段患儿特点，开发阶梯式康复课程体系，包含语言沟通、社交互动、生活自理等核心能力训练模块。医院与杭州市残联合作开展社区康复项目，形成医院-家庭-社区三级干预网络。
3.浙江省立同德医院
浙江省立同德医院儿童康复中心开展自闭症中西医结合治疗，将传统针灸、推拿与现代行为相结合。中心设置个别训练室、团体辅导室及家长培训室，配备脑电生物反馈仪、经颅磁刺激仪等物理治疗设备。医院创新开发"五感刺激"，通过视觉、听觉、触觉等多感官整合训练改善患儿症状。建立数字化康复档案系统，实现训练效果动态监测和方案及时调整，年康复人次超过1500例。
4.杭州市第一人民医院
杭州市第一人民医院儿童保健科开展自闭症早期筛查与干预服务，针对18-36个月幼儿提供M-CHAT筛查及后续诊断评估。医院开设家长指导课堂，培训家庭干预技巧，构建以家庭为中心的自然情境训练模式。康复训练区配备虚拟现实技术设备，通过情境模拟提升患儿社会适应能力。医院与辖区幼儿园建立转介机制，为轻症患儿提供融合教育支持。
5.杭州市儿童医院
杭州市儿童医院儿童康复科开展自闭症谱系障碍综合康复项目，重点发展语言行为干预和社交故事。医院设置模拟超市、公交等生活场景训练区，培养患儿实际生活技能。引进台湾自闭症康复体系，开发本土化训练课程，包含注意力训练、情绪管理等12个模块。定期组织家长互助会，建立患儿康复档案追踪系统，提供从学龄前到青春期的连续性服务。
