南京牙齿矫正比较好的医院有江苏省口腔医院、南京市口腔医院、南京医科大学附属口腔医院、东部战区总医院口腔科、南京鼓楼医院口腔科等。这些医院在牙齿矫正领域拥有丰富的临床经验和的技术设备，能够为患者提供专业的正畸治疗服务。
江苏省口腔医院是华东地区规模大的口腔专科医院之一，正畸科技术力量雄厚。南京市口腔医院作为三级甲等口腔专科医院，在隐形矫正和儿童早期矫治方面具有特色。南京医科大学附属口腔医院依托高校科研优势，在复杂错颌畸形矫正方面积累了丰富经验。
江苏省口腔医院正畸科是江苏省临床重点专科，拥有30余台牙科综合治疗椅。科室开展各类固定矫治、功能矫治和隐形矫治技术，尤其在骨性错颌畸形的正畸-正颌联合治疗方面具有优势。医院引进了国际的iTero口扫系统和3D打印技术，能够为患者提准的数字化正畸方案。每年完成各类牙齿矫正病例2000余例，在青少年错颌畸形早期干预和成人复杂病例矫治方面经验丰富。
南京市口腔医院正畸科是南京市医学重点学科，配备有全套德国进口设备。科室特色项目包括无托槽隐形矫治、自锁托槽矫治和舌侧矫治技术，其中隐形矫治年接诊量位居全省前列。医院建立了完善的正畸治疗质量控制体系，从初诊检查到保持器佩戴全程规范化操作。针对不同年龄患者需求，开展儿童早期矫治、青少年综合矫治和成人美学矫治等专项服务。
南京医科大学附属口腔医院正畸科集医疗、教学、科研于一体，拥有多项自主创新的正畸技术。科室在埋伏牙牵引、开颌矫正等疑难病例治疗方面形成特色，开展个性化舌侧矫治和隐形矫治技术。医院配备数字化全景机、锥形束CT等设备，能够实现三维诊断和治疗。每年举办多期继续教育项目，推动正畸新技术在临床的应用。
东部战区总医院口腔科正畸专业组在军事口腔医学领域具有优势。科室开展传统金属托槽、陶瓷托槽及各类隐形矫治技术，特别在军人职业特殊需求的正畸治疗方面经验丰富。拥有独立的正畸诊区和技工室，可实现矫治器的个性化定制。针对颌面部创伤后畸形、牙周病伴错颌畸形等复杂病例建立了多学科联合诊疗模式。
南京鼓楼医院口腔科正畸组是医院特色专科之一，开展各类国际主流矫治技术。科室注重矫治过程的美观性和舒适性，提供陶瓷托槽、隐形矫治等多种选择。配备数字化牙模分析系统，能够精确制定个性化治疗方案。在成人二次矫治、修复前正畸等特色项目上形成技术优势，并与修复科、种植科建立协作关系。
