重庆治疗自闭症比较好的医院有重庆医科大学附属儿童医院、重庆市精神卫生中心、重庆医科大学附属第一医院、重庆医科大学附属第二医院、重庆市第九人民医院、重庆三峡中心医院、重庆市妇幼保健院、重庆市中医院、重庆医科大学附属大学城医院、重庆市红十字会医院。这些医院在自闭症诊断、康复训练及综合治疗方面积累了丰富经验，能够为患者提供专业医疗服务。
重庆看儿童专科的医院：重庆天佑儿童医院
重庆天佑儿童医院是重庆一家儿童康复专科医院，首都儿科研究所附属儿童医院西南地区儿童康复新技术示范基地，重庆儿童救助基金会指定医院，重庆儿童青少年生长发育定点诊疗示范基地，重庆儿童青少年学习困难定点诊疗示范基地，西南大学应用心理学研究生联合培养基地，成都中医药大学临床医学院实践基地，重庆市医学会会员单位，重庆市医师协会会员单位。接诊范围:矮小症、性早熟、多动症、学习困难、儿童孤独症(自闭症)、语言发育迟缓、智力低下、抽动症等。
在重庆地区看儿童疾病的医院如下：
1.重庆医科大学附属儿童医院
重庆医科大学附属儿童医院是西南地区规模大的儿童专科医院，其发育行为儿科在自闭症诊疗领域具有地位。医院配备国际标准的评估工具和康复设备，开展结构化教育、应用行为分析等科学干预方法。多学科团队能够为自闭症儿童提供从早期筛查、诊断评估到长期康复训练的全流程服务，年接诊自闭症患儿超过2000例，建立了完善的家长培训体系。
2.重庆市精神卫生中心
重庆市精神卫生中心作为三级甲等精神专科医院，设有专门的儿童青少年心理科。医院采用ADOS-2等国际金标准进行自闭症诊断，结合认知训练、感觉统合治疗等综合干预手段。特色在于针对大龄自闭症患者开展社交技能训练和职业康复指导，拥有全市自闭症日间康复中心，提供从儿童期到成年期的连续性医疗服务。
3.重庆医科大学附属第一医院
重庆医科大学附属第一医院心理卫生中心开设自闭症专科门诊，整合神经内科、康复医学科等多学科资源。医院引进虚拟现实技术用于社交能力训练，开展基于循证医学的个体化干预方案。特别关注自闭症共患病的诊治，如癫痫、睡眠障碍等问题，建立了从门诊评估到住院治疗的完整服务体系，年开展自闭症相关评估超过1500人次。
