南京治疗小儿抽动症比较好的医院有南京脑科医院、南京儿童医院、江苏省中医院、东南大学附属中大医院、南京市第一医院。这些医院在小儿神经系统疾病诊疗领域具备丰富经验，其中南京脑科医院儿童心理卫生研究中心是全国重点专科，南京儿童医院神经内科年接诊量超万人次，江苏省中医院则采用中西医结合特色。
1.南京脑科医院
南京脑科医院儿童心理卫生研究中心是国家临床重点专科建设单位，设有专门的小儿抽动症诊疗团队。医院配备儿童行为观察室、脑电图监测系统等专业设备，采用行为干预、药物治疗等综合方案。针对难治性病例可开展经颅磁刺激等物理治疗，年收治抽动症患儿超2000例，建立了个体化的长期随访管理体系。医院定期举办家长课堂，帮助家庭掌握居家护理技巧。
2.南京儿童医院
南京儿童医院神经内科开设抽动障碍专病门诊，拥有儿童视频脑电监测、基因检测等诊断技术。临床采用欧洲儿童神经病学会诊疗标准，针对不同分型制定阶梯式治疗方案。医院特别关注共患多动症、强迫症等并发症的联合治疗，开展感觉统合训练、生物反馈等非药物。其诊疗方案纳入江苏省儿科质控标准，近三年收治病例达85%以上。
3.江苏省中医院
江苏省中医院儿科开展"针药结合"特色，将耳穴压豆、头皮针等传统中医与现代康复技术结合。医院研发的熄风止痉方剂获国家专利，配合推拿手法可显著改善运动性抽动症状。建立中医体质辨识系统，根据患儿不同证型个性化调配中药制剂，减少西药。每年举办"儿童抽动症中西医结合诊疗"继续教育项目，治疗方案被纳入长三角中医儿科诊疗规范。
4.东南大学附属中大医院
东南大学附属中大医院儿科神经专科开展抽动症多学科联合诊疗模式，整合神经内科、心理科及康复科资源。医院引进美国耶鲁抽动症整体严重程度量表进行评估，采用认知行为配合小剂量药物方案。特色项目包括神经反馈训练、虚拟现实行为矫正系统，对发声性抽动患儿提供专业言语训练。参与制定中国抽动症诊疗共识指南，临床数据纳入国家儿童健康信息平台。
5.南京市第一医院
南京市第一医院儿科设立儿童神经行为发育中心，配备日本光电视频脑电图仪等设备。开展抽动症从筛查到康复的全流程管理，建立症状日记监测系统实现用药调整。特色技术包括经皮穴位电刺激、团体心理干预课程，对共患学习障碍患儿提供学业能力评估。医院与社区医疗机构建立双向转诊网络，实现急性期治疗与稳定期管理的无缝衔接。
