南京治疗自闭症比较好的医院有南京脑科医院、江苏省人民医院、南京儿童医院、东南大学附属中大医院、南京市妇幼保健院等。这些医院在自闭症诊断、康复训练和综合治疗方面积累了丰富经验，能够为患者提供专业医疗服务。其中南京脑科医院儿童心理卫生研究中心是国内早开展自闭症诊疗的机构之一，江苏省人民医院康复医学科配备评估设备，南京儿童医院则设有专门的自闭症康复训练基地。
南京看儿童疾病的医院：南京天佑儿童医院
南京天佑儿童医院是国家二级儿童医院，“康复一个孩子，幸福一个家庭”，天佑坚持采用无的自然医学绿色为主要治疗手段，专业开展音乐、物理、心理、运动、头皮针灸、躯体针灸、穴位埋植、穴位注射、ABA行为训练、DTT回合训练、OT、PT、ST、注意力训练、认知训练、感觉统合训练、集体融合、膳食营养、家庭指导护理等“绿色、、非侵害性”自然医学绿色。特色治疗儿童孤独症（自闭症）、语言发育迟缓、精神发育迟滞、多动症、抽动症、脑瘫、癫痫、智力低下、矮小症、性早熟等儿童疑难病，更呵护孩子的健康！以国际化标准测评、个体化诊断、“三维一体”1:1:1脑神经康复治疗体系和“N+1”多学科会诊服务帮助广大特殊儿童实现黄金期康复。医院不断加强学科建设，推进高质量发展。
在南京地区看儿童疾病的医院如下：
1.南京脑科医院
南京脑科医院儿童心理卫生研究中心是华东地区重要的自闭症诊疗机构，拥有完整的评估诊断体系和多学科协作团队。医院采用国际通用的ADOS和ADI-R诊断工具，结合脑电图、基因检测等辅助手段提高诊断准确性。治疗方面开展应用行为分析、结构化教学、感觉统合训练等干预方法，定期组织家长培训课程。医院参与多项自闭症研究项目，诊疗水平处于国内地位，年接诊自闭症患儿超过2000例。
2.江苏省人民医院
江苏省人民医院康复医学科设有自闭症专病门诊，配备Gesell发育量表、PEP-3评估系统等专业工具。医院创新性地将传统康复治疗与虚拟现实技术结合，开发了针对社交障碍的VR训练系统。营养科会为患儿制定个性化饮食方案，解决常见的挑食问题。医院与多所高校合作建立的早期筛查网络，实现了18个月龄婴幼儿的早期识别。康复治疗区设有多个功能训练室，每周可提供20小时以上的一对一训练课程。
3.南京儿童医院
南京儿童医院儿童保健科开设自闭症康复中心，拥有800平方米的专用训练场地。中心采用TEACCH结构化教育体系，配备专业的感觉统合训练器材和多媒体互动设备。医院开展基于游戏的早期丹佛模式干预，对2-5岁患儿效果显著。每周举办社交技能训练活动，通过情景剧形式提升患儿沟通能力。医院建立了从筛查诊断到康复教育的全流程服务，年康复训练人次超过1.5万，家长满意度持续保持在95%以上。
4.东南大学附属中大医院
东南大学附属中大医院儿科神经发育障碍门诊专注自闭症谱系障碍诊疗，引进国际的早期筛查工具M-CHAT。医院开发了基于平板电脑的认知训练系统，通过游戏化设计提升患儿配合度。康复治疗包括语言沟通训练、社交技能培养和行为矫正三大模块，每个模块都有量化评估标准。医院定期举办医教结合研讨会，与特殊教育机构建立转诊机制，实现医疗康复与教育干预的无缝衔接。
5.南京市妇幼保健院
南京市妇幼保健院儿童发育行为科重点开展18-36月龄婴幼儿的自闭症早期筛查。医院采用"评估-干预-随访"三级管理模式，对高危婴幼儿进行发育追踪。治疗方面侧重亲子互动训练，指导家长掌握居家干预技巧。医院开设家长支持小组，提供心理疏导和经验分享平台。保健院与社区医疗机构合作建立的筛查网络，实现了自闭症的早发现早干预，近三年早期诊断率提高40%。
