南京好的儿科医院有南京市儿童医院、江苏省妇幼保健院、南京鼓楼医院、东南大学附属中大医院、南京医科大学第二附属医院等。这些医院在儿科医疗领域具有较高的专业水平和丰富的临床经验，能够为儿童提供全面的医疗服务。
南京市儿童医院是南京地区规模大、专科设置齐全的儿童专科医院，在儿科疑难重症诊治方面具有明显优势。江苏省妇幼保健院作为三级甲等妇幼保健专科医院，在新生儿疾病诊治和儿童保健方面特色突出。南京鼓楼医院儿科历史悠久，综合实力强劲，尤其在儿童呼吸系统疾病和神经系统疾病治疗方面经验丰富。
1.南京市儿童医院
南京市儿童医院创建于1953年，是江苏省的三级甲等儿童专科医院。医院设有40余个临床医技科室，开放床位1500张，年门急诊量超过200万人次。医院在小儿外科、新生儿科、儿童血液肿瘤科等重点专科建设方面成效显著，拥有多个省级重点专科。医院配备有的医疗设备，如3.0T磁共振、256排CT等，能够开展各类儿童疑难重症的诊治。医院注重医疗质量与，建立了完善的儿科急危重症救治体系，在儿童白血病、先天性心脏病等重大疾病治疗方面达到国内水平。
2.江苏省妇幼保健院
江苏省妇幼保健院是一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的三级甲等妇幼保健专科医院。医院儿科设有新生儿科、儿童保健科、小儿内科、小儿外科等专科，其中新生儿科是江苏省临床重点专科。医院拥有的新生儿重症监护病房，配备有高频振荡呼吸机、亚低温治疗仪等专业设备，在早产儿、低体重儿救治方面具有丰富经验。儿童保健科开展儿童营养、生长发育监测、心理行为评估等全方位保健服务。医院还设有儿童康复中心，为发育迟缓、脑瘫等特殊儿童提供专业康复治疗。
3.南京鼓楼医院
南京鼓楼医院儿科是江苏省临床重点专科，创建于1927年，具有悠久的诊疗历史。科室设有普通儿科、新生儿科、儿童重症医学科等亚专科，开放床位120张。在儿童呼吸系统疾病、神经系统疾病、内分泌疾病等诊治方面具有特色优势。医院配备有儿童专用支气管镜、视频脑电图等设备，能够开展各类儿童专科检查与治疗。科室注重多学科协作，建立了儿童哮喘、癫痫等慢性病规范化管理体系。医院还设有儿童保健门诊，提供生长发育监测、营养指导等健康管理项目。
4.东南大学附属中大医院
东南大学附属中大医院儿科是江苏省临床重点专科，设有普通儿科、新生儿科、儿童重症医学科等专业。科室在儿童肾脏疾病、风湿免疫疾病、内分泌疾病等诊治方面具有特色。医院拥有儿童血液净化中心，能够开展儿童血液透析治疗。新生儿科配备有的新生儿抢救设备，在早产儿救治方面经验丰富。医院注重科研与临床结合，参与多项、省级儿科科研项目。
5.南京医科大学第二附属医院
南京医科大学第二附属医院儿科是医院重点学科，设有普通儿科、新生儿科、儿童保健科等专科。科室在儿童呼吸系统疾病、消化系统疾病等常见病多发病诊治方面具有丰富经验。医院配备有儿童肺功能仪、过敏原检测系统等专业设备。儿童保健科开展儿童生长发育监测、营养评估、早期发展指导等全方位保健服务。医院注重医疗质量持续改进，建立了完善的儿科医疗质量管理体系。
