上海治疗儿科疾病比较好的医院有复旦大学附属儿科医院、上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心、上海市儿童医院、上海新华医院、上海瑞金医院、上海第九人民医院、上海第一人民医院、上海同济医院、上海长海医院、上海东方医院。其中，复旦大学附属儿科医院、上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心、上海市儿童医院在儿科领域具有较高的声誉和丰富的临床经验。
1.复旦大学附属儿科医院
复旦大学附属儿科医院是国内的儿童专科医院之一，拥有完善的儿科诊疗体系和的医疗设备。医院设有多个儿科亚专科，包括新生儿科、呼吸科、消化科、神经科等，能够全面覆盖各类儿科疾病的诊治需求。医院在儿童疑难重症救治方面具有丰富经验，尤其在早产儿救治、儿童白血病、先天性心脏病等领域处于国内水平。医院还设有儿童保健科，提供儿童生长发育监测、营养指导等全方位健康管理服务。
2.上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心
上海儿童医学中心是国家儿童医学中心的重要组成部分，在儿科医疗、教学、科研方面都具有显著优势。医院拥有国内的儿童心血管病中心，在先天性心脏病介入治疗和外科手术方面具有突出优势。医院还设有儿童血液肿瘤中心、儿童发育行为儿科等重点专科，提供从新生儿到青少年的全周期医疗服务。医院环境充分考虑儿童特点，设有儿童友好型诊疗区域，减轻患儿就诊时的紧张情绪。
3.上海市儿童医院
上海市儿童医院是上海历史悠久的儿童专科医院之一，在儿科常见病、多发病诊治方面积累了丰富经验。医院设有急诊科、内科、外科等基础科室，同时拥有儿童内分泌科、肾脏科、免疫科等特色专科。医院在儿童慢性病管理方面具有特色，建立了完善的随访体系。医院还注重儿童心理健康，设有专门的心理行为科，为有需要的儿童提供心理评估和干预服务。
4.上海新华医院
上海新华医院儿科是上海市重点学科，在儿童呼吸系统疾病、消化系统疾病诊治方面具有优势。医院儿科设有普通门诊、专家门诊和特需门诊，满足不同层次的就诊需求。医院拥有独立的儿童急诊区域，能够提供24小时儿科急诊服务。在儿童重症救治方面，医院配备了专业的儿科重症监护团队和的生命支持设备。
5.上海瑞金医院
上海瑞金医院儿科是综合性医院中的优势学科，在儿童内分泌疾病、遗传代谢病诊治方面具有特色。医院儿科与成人科室密切合作，为需要多学科协作的复杂病例提供综合诊疗方案。医院设有儿童专科门诊，针对特定疾病提供专业化诊疗服务。医院还注重儿童健康管理，提供生长发育评估、疫苗接种等预防保健服务。
