北京治疗脊索瘤比较好的医院有北京协和医院、北京大学第三医院、中国人民解放军总医院（301医院）、北京天坛医院、首都医科大学宣武医院、北京积水潭医院、中日友好医院、北京同仁医院等。这些医院在神经外科或肿瘤治疗领域具有较高的专业水平，能够为脊索瘤患者提供全面的诊疗服务。
1.北京协和医院
北京协和医院神经外科是国内早成立的神经外科之一，在脊索瘤诊治方面积累了丰富经验。医院配备的影像诊断设备和手术导航系统，能够定位肿瘤位置。采用显微外科技术结合放射治疗的综合方案，显著提高了手术全切率和患者生存质量。医院建立了多学科会诊机制，为复杂病例制定个性化治疗方案。
2.北京大学第三医院
北京大学第三医院神经外科在颅底肿瘤手术方面具有突出优势。医院引进了国际的术中磁共振系统和神经电生理监测设备，为脊索瘤手术提供保障。特别在经鼻内镜颅底手术领域处于国内地位，能够通过微创方式切除肿瘤。术后配合质子治疗等放疗技术，有效控制肿瘤复发。
3.中国人民解放军总医院（301医院）
解放军总医院神经外科在复杂颅底肿瘤治疗方面经验丰富。医院拥有复合手术室和术中CT等高端设备，支持开展高难度脊索瘤切除术。建立了完善的术后康复体系，包括物理治疗和功能训练。医院参与多项国际临床试验，能够为患者提供新的靶向药物治疗方案。
4.北京天坛医院
北京天坛医院作为神经科学专科医院，在脊索瘤诊疗方面具有独特优势。医院神经外科年手术量居全国前列，积累了大量的临床病例数据。配备有伽玛刀、射波刀等放射外科设备，为不适合手术的患者提供替代治疗方案。建立了规范的随访制度，长期跟踪患者预后情况。
5.首都医科大学宣武医院
宣武医院神经外科在颅底显微外科技术方面具有特色。医院采用三维重建技术辅助手术规划，提高肿瘤切除的精确度。建立了完善的病理诊断平台，能够准确鉴别脊索瘤亚型。开展术中超声监测等新技术，评估手术效果。医院注重功能保护，大限度减少手术对神经功能的影响。
