宿迁市专科医院排行榜中表现突出的医疗机构包括宿迁市第一人民医院、南京鼓楼医院集团宿迁医院、宿迁市钟吾医院、宿迁市儿童医院以及宿迁市中医院。这些医院在专科领域各具特色，为当地居民提供了高质量的医疗服务。宿迁市第一人民医院作为综合性三甲医院，专科设置齐全；南京鼓楼医院集团宿迁医院依托优质医疗资源，专科实力强劲；宿迁市钟吾医院则以特色专科见长，在区域内享有较高声誉。
宿迁市第一人民医院是宿迁地区的三级甲等综合性医院，开设临床医技科室42个，其中省级临床重点专科2个，市级重点专科16个。医院配备3.0T磁共振、256层螺旋CT等设备，年门急诊量超百万人次。在心血管内科、神经外科、骨科等专科领域具有明显优势，开展的心脏介入手术、脑血管介入治疗等技术达到省内水平。医院作为南京医科大学附属医院，注重医教研协同发展，近年来获得多项省市级科研立项。
南京鼓楼医院集团宿迁医院由南京鼓楼医院全面托管，开放床位1200张，设有35个临床科室。医院重点打造了肿瘤中心、卒中中心、胸痛中心三大专科平台，其中肿瘤科年收治患者量居全市。医院引进PET-CT、直线加速器等高端设备，开展肿瘤放疗、微创介入等特色技术。作为宿迁市医保定点单位，医院实行与南京鼓楼医院同质化管理，定期有专家团队驻点坐诊，让患者在家门口享受优质医疗服务。
宿迁市钟吾医院创建于1945年，现为二级甲等综合医院，实际开放床位800张。医院特色专科包括消化内科、呼吸内科和康复医学科，其中消化内镜中心年检查量超过2万例。医院配备奥林巴斯290内镜系统、全自动生化分析仪等专科设备，开展无痛胃肠镜、ERCP等特色项目。作为宿迁市职业病防治定点医院，在职业健康检查与诊断方面具有独特优势。医院近年投入5000余万元进行基础设施改造，就医环境得到显著改善。
宿迁市儿童医院是全市的二级儿童专科医院，设置儿科床位200张，年门诊量约30万人次。医院开设新生儿科、小儿呼吸科、小儿神经科等特色专科，其中新生儿重症监护室配备进口暖箱、呼吸机等专业设备。医院开展儿童哮喘标准化门诊、儿童生长发育评估等特色服务，承担全市儿童急危重症救治任务。作为市儿科质控中心挂靠单位，医院牵头制定全市儿科诊疗规范，定期组织基层儿科医师培训。
宿迁市中医院是国家三级中医医院，开放床位600张，设有26个临床科室。医院重点发展针灸科、推拿科、骨伤科等中医特色专科，其中针灸科为省级重点专科。开展小针刀、穴位埋线等30余种中医适宜技术，年服务患者超10万人次。医院建有标准化中药房，提供中药饮片调剂、代煎等服务。作为宿迁市中医药适宜技术推广基地，医院定期举办中医养生讲座，推广"治未病"理念，在慢性病管理方面形成特色优势。
