呼和浩特市专治不孕不育比较好的医院有内蒙古自治区人民医院、内蒙古医科大学附属医院、呼和浩特市第一医院、内蒙古妇幼保健院、呼和浩特市妇幼保健计划生育服务中心等。其中，内蒙古自治区人民医院作为三甲综合医院，在不孕不育诊疗领域设备，科室设置完善；内蒙古医科大学附属医院生殖医学中心是内蒙古地区较早开展辅助生殖技术的机构之一，临床经验丰富；呼和浩特市第一医院妇科在不孕症诊治方面具有特色，注重个体化治疗方案。
1.内蒙古自治区人民医院
内蒙古自治区人民医院生殖医学中心成立于2002年，是内蒙古地区规模较大的不孕不育诊疗机构。中心拥有标准化实验室和设备，可开展体外受精-胚胎移植、卵胞浆内单精子显微注射等辅助生殖技术。医院年门诊量超过5万人次，试管婴儿临床妊娠率保持在50%以上。除辅助生殖技术外，医院还设有男性不育专科门诊，配备精液分析仪等专业设备，为不孕不育患者提供全方位诊疗服务。医院注重科研与临床结合，近年来在生殖内分泌疾病诊治方面取得多项科研成果。
2.内蒙古医科大学附属医院
内蒙古医科大学附属医院生殖医学中心是经卫生部批准开展人类辅助生殖技术的医疗机构。中心建筑面积2000余平方米，设有女性不孕门诊、男性不育门诊、遗传咨询门诊等专科。医院拥有胚胎实验室、精液处理室等功能区，配备时间lapse培养系统等设备。中心可开展常规试管婴儿、冻融胚胎移植、睾丸穿刺取精等多项技术，累计完成试管婴儿周期数超过5000例。医院在不孕症合并子宫内膜异位症、多囊卵巢综合征等疑难病例的诊治方面具有丰富经验。
3.呼和浩特市第一医院
呼和浩特市第一医院妇产科是医院重点学科，在不孕不育诊治方面形成特色。科室设有生殖内分泌门诊，配备宫腔镜、腹腔镜等微创手术设备，可开展输卵管造影、宫腔粘连分离等检查治疗。医院采用中西医结合方法治疗排卵障碍、黄体功能不全等内分泌性不孕，取得良好效果。对于男性少弱精症患者，医院开展精索静脉曲张显微结扎术等手术治疗。医院生殖中心与北京、上海等地知名生殖医学中心保持技术合作，定期邀请专家进行会诊指导。
4.内蒙古妇幼保健院
内蒙古妇幼保健院生殖健康科是自治区妇幼保健系统内规模较大的不孕不育诊疗专科。科室开展不孕症系统检查、促排卵治疗、宫腔内人工授精等基础助孕技术。医院拥有数字化阴道超声仪、全自动激素检测系统等设备，能够准确评估卵巢储备功能。针对复发性流产患者，医院开展免疫因素筛查和针对性治疗。医院注重生殖健康宣教，定期举办不孕不育知识讲座，帮助患者正确认识疾病。
5.呼和浩特市妇幼保健计划生育服务中心
呼和浩特市妇幼保健计划生育服务中心生殖健康科主要开展不孕不育基础诊疗服务。科室配备阴道B超、输卵管通液仪等基础设备，能够完成排卵监测、输卵管通畅性检查等项目。医院开展男性精液常规分析、精子形态学检查等基础检测，为不孕不育诊断提供依据。对于需要辅助生殖技术治疗的患者，医院与上级生殖中心建立转诊绿色通道。医院还提供孕前优生健康检查服务，帮助育龄夫妇做好生育准备。
