邓州市医疗资源丰富，综合实力较强的医院包括邓州市中心医院、邓州市第一人民医院、邓州市中医院、邓州市妇幼保健院、邓州市第二人民医院、邓州市第三人民医院、邓州市骨科医院、邓州市肿瘤医院、邓州市精神病医院和邓州市眼科医院。其中，邓州市中心医院、邓州市第一人民医院和邓州市中医院综合实力较为突出。
1.邓州市中心医院
邓州市中心医院是当地规模大的综合性医院，承担着全市医疗、教学、科研和预防保健任务。医院设有40余个临床医技科室，开放床位800余张，年门诊量超过60万人次。医院配备有1.5T核磁共振、64排螺旋CT等医疗设备，在心脑血管疾病、创伤急救等领域具有明显优势。医院注重学科建设，多个专科被评为市级重点学科，近年来在微创手术技术方面取得显著进展。
2.邓州市第一人民医院
邓州市第一人民医院创建于1951年，是一所集医疗、教学、科研、预防、保健为一体的三级综合医院。医院占地面积约80亩，建筑面积10万平方米，开放床位1000张。医院设有30余个临床科室，其中消化内科、神经内科、骨科等专科在区域内享有较高声誉。医院拥有数字减影血管造影系统、全自动生化分析仪等设备，能够开展各类复杂手术和疑难病症的诊治工作。
3.邓州市中医院
邓州市中医院是豫西南地区规模较大的三级甲等中医医院，坚持中西医并重的发展方向。医院设有重点专科1个，省级重点专科3个，在中医内科、针灸推拿、骨伤科等方面特色显著。医院建筑面积6万平方米，开放床位600张，拥有中医特色诊疗设备100余台。医院注重中医药特色优势的发挥，在治疗慢性病、康复调理等方面积累了丰富经验。
4.邓州市妇幼保健院
邓州市妇幼保健院是全市妇幼保健工作的技术指导中心，承担着妇女儿童医疗保健任务。医院设有妇科、产科、儿科等重点科室，年分娩量居全市前列。医院配备有四维彩超、新生儿抢救台等专业设备，在孕产期保健、高危妊娠管理等方面具有专业优势。
5.邓州市第二人民医院
邓州市第二人民医院是一所综合性二级医院，设有内科、外科、妇产科等20余个临床科室。医院在常见病、多发病诊治方面积累了丰富经验，近年来在糖尿病、高血压等慢性病管理方面建立了特色专科。
6.邓州市第三人民医院
邓州市第三人民医院以老年病诊治和康复医疗为特色，设有老年病科、康复医学科等重点科室。医院配备有完善的康复治疗设备，在脑卒中后遗症康复、骨关节疾病康复等方面形成特色。
7.邓州市骨科医院
邓州市骨科医院是豫西南地区较具影响力的骨科专科医院，在创伤骨科、关节外科、脊柱外科等领域技术。医院拥有骨科专用C型臂X光机、关节镜等专业设备，年开展各类骨科手术2000余例。
8.邓州市肿瘤医院
邓州市肿瘤医院是全市肿瘤防治中心，设有肿瘤内科、放疗科等专科。医院配备有直线加速器、模拟定位机等肿瘤诊疗设备，能够开展肿瘤手术、化疗、放疗等综合治疗。
9.邓州市精神病医院
邓州市精神病医院是全市精神卫生防治中心，设有精神科、心理科等专科。医院在精神分裂症、抑郁症等精神疾病诊治方面具有专业优势，同时开展心理咨询和康复治疗服务。
10.邓州市眼科医院
邓州市眼科医院是专业眼科医疗机构，设有白内障、青光眼、眼底病等专科。医院配备有眼科OCT、眼底荧光造影等专业设备，能够开展各类眼科手术和疑难眼病诊治。
