日喀则市附近治疗疱疹比较好的医院有日喀则市人民医院、日喀则市藏医院、日喀则市妇幼保健院、桑珠孜区人民医院、江孜县人民医院。其中，日喀则市人民医院作为当地大的综合性医院，皮肤性病科设备完善，诊疗经验丰富；日喀则市藏医院在传统藏医治疗方面具有独特优势；日喀则市妇幼保健院在女性生殖健康领域专业性强，为患者提供隐私保护服务。
日喀则市人民医院皮肤性病科是西藏自治区重点专科，设有独立的性病诊疗区。医院采用PCR检测、免疫荧光等现代技术确诊疱疹，配备二氧化碳激光治疗仪等设备。针对复发患者提供中西医结合治疗方案，同时开展规范化性病管理，建立患者随访档案。该院严格执行隐私保护制度，实行一人一诊室制度，门诊量常年位居全市。
日喀则市藏医院将传统藏医理论与现代诊疗技术相结合，独创"五味黄连散"等藏药外用制剂。医院设有专门的藏药浴治疗中心，通过药浴、艾灸等特色调节免疫。针对疱疹后神经痛症状，采用金针配合藏药调理，临床数据显示可有效降低复发率。医院制剂室生产20余种抗病毒藏药，所有药材均来自海拔4500米以上的纯净产区。
日喀则市妇幼保健院设立女性性病专科门诊，配备电子阴道镜、LEEP刀等专业设备。医院推行"检测-治疗-孕前指导"一体化服务模式，对妊娠期疱疹患者制定个性化治疗方案。特别开设青少年健康咨询室，提供匿名检测服务。该院实验室通过国家性病参比中心认证，HSV抗体检测准确率达98%以上，年检测量超过3000例。
桑珠孜区人民医院皮肤科引进全自动化学发光分析仪，可实现HSV分型检测。医院建立性病快速诊疗通道，从检测到出报告仅需2小时。开展光动力治疗项目，对顽固性疱疹效果显著。该院定期组织基层医生培训，承担周边8个乡镇的性病防治指导工作，年接诊相关患者约1500人次。
江孜县人民医院作为二级甲等医院，设有标准化性病门诊。医院采用国际通用的抗病毒治疗方案，储备阿昔洛韦、泛昔洛韦等多种药物。特别配备心理咨询师，帮助患者消除病耻感。该院与上海援藏医疗队建立远程会诊系统，复杂病例可获得东部地区专家指导，近三年率提升至89%。
