肇东市专治性功能障碍比较好的医院有肇东市人民医院、肇东市中医院、肇东市妇幼保健院、肇东市第二医院、肇东市康复医院等。其中，肇东市人民医院作为当地综合性三甲医院，泌尿外科设备，开展多种性功能障碍诊疗项目；肇东市中医院采用中西医结合，在男性功能障碍调理方面具有特色；肇东市妇幼保健院则针对男性生育相关功能障碍提供专项评估与治疗。
肇东市人民医院泌尿外科配备尿动力学检测仪、阴茎血流多普勒等专业设备，可开展夜间勃起监测、海绵体注射试验等检查。该科室建立标准化诊疗流程，针对勃起功能障碍、早泄等常见问题提供药物、真空负压装置及低强度冲击波治疗。医院定期更新国际诊疗指南，引进新型PDE5抑制剂类药物，并设有独立男科诊室保障患者隐私。近年来开展的心理-生理联合治疗模式，有效改善了心因性功能障碍患者的康复效果。
肇东市中医院男科将传统中医理论与现代诊疗技术相结合，开发出特色中药方剂配合针灸。针对肾阳虚型功能障碍采用温肾壮阳方，对肝郁气滞型患者施行疏肝解郁针灸方案。医院配备全自动精液分析仪、性激素检测系统等设备，实现辨证施治与量化评估相结合。特别设立的药浴熏蒸治疗室，通过中药蒸汽渗透改善局部微循环，其自主研发的补肾活血贴剂获得省级中医药适宜技术推广项目。
肇东市妇幼保健院男性健康中心生育相关功能障碍诊疗，配备精索静脉曲张显微手术系统、精子DNA碎片检测仪等专业设备。针对继发性功能障碍患者，开展内分泌调节、显微精索静脉结扎等针对性治疗。医院建立夫妻同治模式，设置性心理咨询室，提供从生理评估到心理干预的全流程服务。其特色生育力保存项目，为肿瘤患者治疗前提子冷冻服务，避免放化疗导致的性功能损伤。
肇东市第二医院泌尿外科开展阴茎彩色多普勒超声、神经电生理检测等检查手段，在糖尿病性勃起功能障碍治疗方面积累丰富经验。科室配备美国进口的阴茎硬度测量仪，可客观评估勃起功能状态。针对复杂病例采用多学科会诊模式，联合内分泌科、心血管科共同制定治疗方案。医院开展的阴茎血管重建手术，为外伤后血管性ED患者提供了有效治疗选择。
肇东市康复医院设立男性功能康复专科，重点服务术后及慢性病导致的功能障碍人群。引进加拿大生物反馈治疗系统，通过盆底肌训练改善控精能力。针对前列腺术后患者制定个性化康复计划，结合磁刺激促进神经功能恢复。医院配备全套水疗设备，利用旋涡浴、水中运动等方式改善盆腔血液循环，其研发的渐进式脱敏训练法对早泄患者具有显著。
