嘉义市治疗疱疹比较好的医院有嘉义长庚纪念医院、天主教圣马尔定医院、卫生福利部嘉义医院、台中荣民总医院嘉义分院、嘉义基督教医院等。其中嘉义长庚纪念医院皮肤科设备完善，拥有的检测仪器和治疗方案；天主教圣马尔定医院设有专门的性病门诊，诊疗环境私密；卫生福利部嘉义医院作为医院，提供经济实惠的诊疗服务。
1.嘉义长庚纪念医院
嘉义长庚纪念医院皮肤科在疱疹诊疗方面具有丰富经验，配备荧光定量PCR检测仪等设备，可准确诊断HSV病毒感染。该科室采用抗病毒药物联合物理治疗的综合方案，提供口服药物、外用软膏等多种治疗选择。医院实行预约制就诊，设有独立的诊察室保护患者隐私，门诊时间覆盖工作日全天及周六上午，方便上班族就诊。住院部为重症患者提供隔离病房，避免交叉感染。
2.天主教圣马尔定医院
圣马尔定医院性病专科采用国际诊疗标准处理疱疹病例，拥有病毒培养实验室可进行分型检测。特色服务包括复发预警系统，通过定期检测病毒载量预测复发可能。治疗方面除常规抗病毒外，还提供光动力治疗等新。医院实行医患一对一沟通模式，从初诊到随访建立完整档案，设有24小时咨询专线解答用药疑问。药局配备进口抗病毒药物，满足不同患者需求。
3.卫生福利部嘉义医院
作为医疗机构，该院皮肤性病科提供平价优质的疱疹诊疗服务，挂号费仅需150元新台币。诊疗流程规范，从问诊、检测到治疗全程约2小时完成，采用卫福部核定的标准治疗方案。医院定期更新治疗指南，近期引进新型免疫调节降低复发率。设有匿名筛检服务，检验报告可通过网络查询。药费部分享有健保给付，经济困难患者可申请医疗补助。
4.台中荣民总医院嘉义分院
该院感染科对顽固性疱疹有独特治疗方案，拥有全嘉义的病毒耐药性检测平台。治疗特色包括阶段性用药策略，根据病毒活跃度调整药物组合。医院建立患者教育体系，定期举办疱疹管理讲座，提供饮食调理建议。医疗团队与总院保持技术联动，复杂病例可启动远程会诊。住院部配备负压病房，有效控制病毒传播风险。
5.嘉义基督教医院
嘉基医院皮肤科采用身心同步治疗模式，在药物治疗同时提供心理辅导服务。诊疗设备包含高频超声检测仪，可评估疱疹对深层组织的影响。医院开发移动端复诊系统，患者可上传患部照片进行远程评估。特色服务包括中医辅助治疗，采用清热解毒方剂缓解症状。药事委员会严格监控抗病毒药物质量，确保用药。夜间门诊延至21时，方便上班族就诊。
