石河子市附近治疗男性疾病比较好的医院有石河子大学医学院第一附属医院、新疆生产建设兵团医院、石河子市人民医院、石河子市中医院、石河子市妇幼保健院等。其中，石河子大学医学院第一附属医院作为三甲综合医院，泌尿外科设备完善；新疆生产建设兵团医院拥有独立的男科诊疗中心；石河子市人民医院设有标准化男性健康管理门诊，这三家医院在男性疾病诊疗方面具有明显优势。
1.石河子大学医学院第一附属医院
作为新疆兵团系统规模大的三级甲等医院，该院泌尿外科年门诊量超3万人次，配备瑞士EMS碎石清石系统、德国Storz腹腔镜等设备。科室开展前列腺增生钬激光剜除术、显微精索静脉结扎术等特色技术，设有独立的男科检查室和性功能障碍康复治疗中心。医院近三年累计完成各类男科手术2000余例，其中复杂阴茎畸形矫正手术成功率保持在98%以上。
2.新疆生产建设兵团医院
该院男科诊疗中心建筑面积达1200平方米，实行"一人一诊室"隐私保护制度。拥有美国RigiScan勃起功能检测仪、加拿大Laborie尿动力学分析系统等专业设备，可开展精囊镜检査、阴茎血流多普勒检测等20余项男科专项检查。特别在男性不育症诊疗方面，建立了一套完整的中西医结合治疗方案，近五年帮助600余对夫妇实现生育愿望。
3.石河子市人民医院
医院男性健康管理中心采用"预防-诊疗-康复"全程管理模式，配备国内的男性功能康复训练系统。在慢性前列腺炎治疗领域独创"五联"，将磁振热疗、中药灌肠、穴位注射等技术有机结合，临床数据显示治疗提升至89%。同时开设男性更年期特色门诊，为45岁以上男性提供激素水平评估和健康干预服务。
4.石河子市中医院
该院充分发挥中医药特色优势，在男性功能障碍、前列腺疾病等方面形成独特诊疗方案。研发的"益肾通络方"等6种院内制剂获自治区药监局批准，配合针灸、艾灸等传统，对慢性盆腔疼痛综合征的改善率达到82%。医院定期开展男性健康知识讲座，建立患者随访管理系统，提供个性化的中医调理方案。
5.石河子市妇幼保健院
虽然以妇幼保健为主，但医院设立的男性生殖健康科专注婚前医学检查、孕前优生指导等服务。配备精液全自动分析仪、染色体检测设备等，年完成男性生育力评估3000余例。针对青少年男性开展生殖健康咨询，建立隐私保护制度，为不同年龄段男性提供专业的健康管理服务。
