牡丹江市治疗疱疹比较好的医院有牡丹江市第一人民医院、牡丹江市第二人民医院、牡丹江医学院附属红旗医院、牡丹江市中医医院、牡丹江市妇幼保健院等。其中，牡丹江市第一人民医院皮肤性病科设备，诊疗经验丰富；牡丹江市第二人民医院在性传播疾病治疗方面具有较高声誉；牡丹江医学院附属红旗医院作为教学医院，在规范化诊疗方面表现突出。
牡丹江市第一人民医院皮肤性病科是市级重点专科，设有独立的性病诊疗区域。该科室配备荧光定量PCR检测仪、全自动化学发光免疫分析仪等设备，可准确检测HSV病毒分型。治疗方面采用中西医结合方式，除常规抗病毒治疗外，还开展光动力等特色项目。医院实行严格隐私保护制度，检验报告可通过线上系统查询，年接诊疱疹病例超过800例，复发率控制指标优于省内平均水平。
牡丹江市第二人民医院感染科设有性病专病门诊，针对疱疹建立标准化诊疗流程。医院拥有病毒载量检测、药物敏感性试验等特色技术，可根据个体差异制定阶梯治疗方案。特别对反复发作病例开展免疫调节治疗，配备有生物反馈治疗仪等物理治疗设备。该院参与国家性病防治监测项目，治疗方案严格遵循新诊疗指南，近三年患者满意度调查保持在95%以上。
作为教学三甲医院，红旗医院皮肤性病科承担着规范化诊疗培训任务。科室建立疱疹专病数据库，对2000余例病例进行长期随访研究。治疗上采用国际通用的抑制和间歇，引进低温等离子治疗仪等新型设备。医院检验科通过ISO15189认证，HSV抗体检测准确率达99.6%，同时开展心理健康评估和干预服务，形成生物-心理-社会医学综合管理模式。
该院皮肤科将传统中医理论与现代诊疗技术相结合，针对疱疹研制出疱疹解毒汤等院内制剂。治疗采用中药熏蒸、穴位注射等特色，配合半导体激光局部照射。对免疫功能低下患者辨证施治，建立个体化调理方案。医院药房提供中药颗粒剂代煎服务，年治疗顽固性疱疹病例300余例，在减少复发方面具有独特优势。
妇幼保健院设立女性生殖道感染专科，重点关注妊娠合并疱疹的母婴阻断。医院配备专用负压诊室，开展TORCH筛查、羊水病毒DNA检测等特色项目。对孕产妇实施分级管理方案，提供抗病毒预防用药指导。新生儿科设有隔离观察病房，具备完善的HSV母婴传播应急处理预案，近五年成功阻断母婴传播病例40余例。
上述医院均开设24小时咨询，部分提供网络预约和结果查询服务。就诊前建议通过官方渠道了解新出诊安排，急性发作期患者可选择设有急诊皮肤科的医疗机构。所有医院均严格执行隐私保护制度，检验治疗过程符合国家院感防控标准。
