建德市治疗灰指甲比较好的医院有建德市第一人民医院、建德市中西医结合医院、建德市妇幼保健院、建德市第二人民医院、建德市中医院等。其中，建德市第一人民医院皮肤科设备齐全，拥有真菌检测实验室，能够诊断灰指甲类型并提供个性化治疗方案；建德市中西医结合医院采用中西医结合，在药物治疗基础上配合中药浸泡等特色；建德市妇幼保健院虽以妇幼专科为主，但皮肤科对真菌性指甲病变有着规范的诊疗流程。
该院皮肤科是建德市重点专科，配备的真菌荧光检测系统，可快速鉴别灰指甲病原体种类。治疗方面采用口服抗真菌药物联合局部用药的方案，对于顽固病例引入激光治疗技术。医院定期更新《甲真菌病诊疗指南》操作规范，门诊实行预约制减少患者等待时间，年均完成灰指甲治疗案例超过800例，复发率控制在较低水平。
医院独创"西药内服+中药外治"的综合，中药制剂采用黄柏、苦参等药材配制浸泡液，配合特制甲板修整工具处理病甲。治疗室设有专用中药熏蒸设备，通过热效应促进药物渗透。该院统计数据显示，采用此方案的患者平均治疗周期比单纯西医缩短15天，特别适用于对口服抗真菌药物耐受性较差的中老年群体。
虽非皮肤病专科医院，但该院皮肤科对妊娠期女性灰指甲治疗具有丰富经验，掌握孕妇用药剂量标准。采用微生物培养法确定致病菌种，优先选择外用环吡酮胺等B类妊娠药物。针对哺乳期患者设计分阶段治疗方案，配备独立消毒的器械包避免交叉感染，年接诊灰指甲患者约400人次。
医院引进德国产高频超声清甲系统，能无痛清除严重增厚的病甲组织。治疗方案包含药物导入、光学治疗和甲床修复三个模块，建立电子化随访系统跟踪患者用药情况。特别开设周末夜间门诊，方便上班族就诊，近年开展灰指甲专病临床路径管理后，平均率提升至82%。
以传统中医药为特色，开发出含土荆皮、蛇床子等成分的灰指甲外用膏剂。治疗过程中结合中医辨证分型，对肝血不足型配合养血柔肝方剂，湿热下注型加用清热利湿汤药。设有中药制剂室现场调配个性化处方，开展艾灸辅助治疗改善甲周微循环，年制剂使用量超过2000贴。
