神经外科成立于2016年。由具有丰富临床、科研经验的小儿神经外科专业医护人员组成。其中医师11人，护士14人。其中高级职称医师5名。博士生1名。硕士生导师1名。拥有良好的专业梯队。

设有门诊、病房。在小儿脑积水、脑脊膜膨出、颅内肿瘤、椎管内肿瘤、血管病、功能性疾病等领域均为国内先进水平。广泛引进高新技术及设备，如术中导航、神经内镜、术中超声吸引器等。

科室特色有：术中应用电生理监测技术，提高脊髓栓系、椎管内脂肪瘤的全切率并保持正常神经功能。神经内镜治疗脑积水、蛛网膜囊肿、肿瘤活检，降低手术花费，减少手术并发症，提高疾病治愈率。术中导航及术中超声技术应用降低了手术创伤。颅内巨大肿瘤手术切除。迷走神经刺激治疗难治性癫痫。

作为北京市住院医师规范化培训儿外科专业基地承担了重要的临床教学工作。承担所级及省市级课题多项，平均每年发表SCI论文1-2篇，国内核心期刊论文5篇。