性传播仍是上海艾滋病的主要感染途径，其中男性同性性传播占比较大。在上海的艾滋病病毒感染者中，通过无保护性行为接触传播艾滋病的占比约为97%，其中约六成为男男性行为传播，约四成为异性性传播。这表明无论是男性同性还是异性间的性行为，若不采取有效的保护措施，感染艾滋病的风险都较高。预防艾滋病有个“ABC”原则，后来发展为“1A、2B、3C、4D”新原则，其中都强调了套的重要性，发生性行为时使用套可以减少感染艾滋病的风险。
目前，上海对血液及血制品传播途径的控制已有“抓手”，如对血液制品采用核酸试剂检测，以确保用血有保障。输入被病毒污染的血液，使用被血液污染而又未经严格消毒的注射器、针灸针、拔牙工具等都是十分危险的。另外，如果与艾滋病病毒感染者共用未消毒的注射器针头，也会被留在针管针头中的病毒所感染。
上海高度重视母婴传播阻断工作，目前已连续多年无母婴传播病例报告。上海积极开展预防艾滋病母婴传播宣传教育、咨询检测、转介服务、阻断干预、分娩、随访监测等防治措施。例如，上海市组织修订了《上海市预防艾滋病、梅毒和乙肝母婴传播工作方案（2024年版）》，并印发了《上海市消除艾滋病、梅毒和乙肝母婴传播行动实施方案（2023-2025年）》，明确各部门职责，加强母婴传播阻断工作。同时，上海建卡孕产妇艾滋病筛查率99.99%，为母婴健康提供了坚实保障。
