南京治疗小儿脑瘫专业的医院有南京儿童医院、江苏省人民医院、南京脑科医院、东南大学附属中大医院、南京市妇幼保健院等。其中，南京儿童医院在小儿神经系统疾病诊疗方面经验丰富，拥有完善的康复设施；江苏省人民医院儿科康复中心设备，开展多学科协作治疗；南京脑科医院在儿童神经发育障碍领域具有特色技术，提供个性化康复方案。
1.南京儿童医院
南京儿童医院神经内科是江苏省临床重点专科，设有专门的小儿脑瘫诊疗中心。医院配备GMFM评估系统、三维步态分析仪等设备，开展运动、作业、语言训练等综合康复项目。医院采用国际通用的Bobath、Vojta等神经发育学，结合中医推拿、针灸等传统手段，形成特色治疗方案。每年接诊脑瘫患儿超千例，在改善运动功能、提高生活自理能力方面效果显著。
2.江苏省人民医院
江苏省人民医院儿科康复中心拥有2000平方米的康复训练区，设有悬吊训练系统、水疗池、智能康复机器人等现代化设备。医院开展肉毒素注射治疗痉挛型脑瘫、选择性脊神经后根切断术等特色技术，建立从早期筛查、诊断到长期康复的全流程管理体系。中心与康复医学科、神经外科等多学科协作，针对不同分型的脑瘫患儿制定个体化康复计划，在改善肌张力异常、矫正畸形方面具有优势。
3.南京脑科医院
南京脑科医院儿童心理卫生研究中心专注儿童神经发育障碍诊疗，设有脑瘫专科门诊。医院引进经颅磁刺激仪、生物反馈治疗仪等设备，开展运动控制训练、认知功能训练等特色项目。在药物治疗基础上，创新性应用音乐、感觉统合训练等辅助手段，对伴随癫痫、智力障碍的复杂病例具有丰富处理经验。医院定期开展家长培训课程，指导家庭康复训练方法。
4.东南大学附属中大医院
东南大学附属中大医院康复医学科设有儿童康复病区，配备德国LokoHelp步态训练机器人、三维动作捕捉系统等设备。医院开展神经肌肉电刺激、矫形器适配等特色治疗，建立包括物理治疗师、作业治疗师、言语治疗师在内的专业团队。针对不同年龄阶段的脑瘫患儿，医院设计阶梯式康复方案，重点改善运动功能障碍和日常生活能力。
5.南京市妇幼保健院
南京市妇幼保健院儿童康复科专注婴幼儿期脑瘫的早期干预，拥有新生儿行为神经评估、全身运动评估等早期筛查技术。医院开展引导式教育、神经发育等特色项目，建立高危新生儿随访制度，实现脑瘫的超早期识别和干预。针对轻度脑瘫患儿，医院设计游戏化康复课程，在改善粗大运动功能的同时注重社交能力培养。
