南京治疗甲状腺疾病比较好的医院有江苏省人民医院、南京鼓楼医院、东南大学附属中大医院、南京市第一医院、南京军区总医院等。其中江苏省人民医院作为全省综合实力强的三甲医院，其内分泌科在甲状腺疾病诊治方面具有显著优势；南京鼓楼医院内分泌代谢病科拥有的检测设备和规范化的诊疗流程；东南大学附属中大医院内分泌科在甲状腺结节微创治疗领域具有丰富经验。
1.江苏省人民医院
江苏省人民医院内分泌科是国家临床重点专科建设单位，设有独立的甲状腺疾病专病门诊。医院配备有高分辨率甲状腺超声、细针穿刺活检等设备，在甲状腺功能亢进、甲状腺炎、甲状腺癌等疾病的诊断和治疗方面形成特色。该科室开展甲状腺结节微波消融术、腔镜甲状腺手术等微创技术，年甲状腺手术量超过800例。医院还建立了多学科协作诊疗模式，为复杂甲状腺疾病患者提供个性化治疗方案。
2.南京鼓楼医院
南京鼓楼医院内分泌科是江苏省重点专科，甲状腺疾病诊疗团队由资深专家组成。科室拥有全套甲状腺功能检测系统，能够开展TRAb、TPOAb等特异性抗体检测。在Graves病治疗方面，采用药物、同位素、手术三位一体的综合治疗方案。医院甲状腺外科每年完成各类甲状腺手术600余例，常规开展喉返神经监测技术，术后并发症发生率低于1%。同时开设甲状腺癌多学科联合门诊，为患者提供全程化管理服务。
3.东南大学附属中大医院
东南大学附属中大医院内分泌科在甲状腺疾病诊治方面具有鲜明特色，特别在甲状腺结节鉴别诊断领域处于省内水平。科室引进弹性超声、超声造影等新技术，显著提高甲状腺癌早期检出率。医院开展的甲状腺细针穿刺细胞学检查年操作量超过2000例，诊断准确率达95%以上。甲状腺外科常规开展经口腔前庭入路腔镜手术，实现颈部无疤痕治疗。医院还建立了甲状腺疾病随访管理系统，对术后患者进行长期跟踪指导。
4.南京市第一医院
南京市第一医院内分泌科是南京市级重点学科，在甲状腺疾病诊治方面积累丰富经验。医院配备有美国GEVolusonE10超声诊断系统，能够清晰显示2mm以上的甲状腺结节。科室开展甲状腺功能全套检测、甲状腺球蛋白测定等特色项目，对桥本甲状腺炎、亚急性甲状腺炎等疾病具有规范化的诊疗流程。甲状腺外科年手术量约500例，熟练开展甲状腺全切、中央区淋巴结清扫等复杂手术，术后五年生存率达到国内水平。
5.南京军区总医院
南京军区总医院内分泌科在甲状腺疾病诊疗方面具有军地融合特色，特别在甲状腺相关眼病治疗上优势明显。医院引进德国西门子ACUSONS2000超声系统，结合弹性成像技术提高甲状腺结节良恶性鉴别能力。科室开展甲状腺激素抵抗综合征、甲状腺激素不敏感综合征等疑难病症的诊治工作。医院核医学科拥有规范的碘-131治疗病房，每年完成甲亢同位素治疗200余例。甲状腺外科开展纳米碳示踪技术，有效保护甲状旁腺功能。
