南京治疗甲状腺疾病比较好的医院有江苏省人民医院、南京鼓楼医院、东部战区总医院、南京市第一医院、江苏省中医院等。其中江苏省人民医院内分泌科在甲状腺疾病诊疗方面具有丰富经验，配备的检查设备；南京鼓楼医院甲状腺外科年手术量位居全省前列，开展多种微创治疗技术；东部战区总医院在甲状腺癌综合治疗方面特色突出，拥有多学科协作团队。
1.江苏省人民医院
江苏省人民医院内分泌科是重点专科，设有独立的甲状腺疾病诊疗中心。医院拥有全套甲状腺功能检测设备，包括第三代化学发光免疫分析仪、甲状腺超声弹性成像系统等。针对不同甲状腺疾病开展个性化治疗，在Graves病、桥本甲状腺炎等自身免疫性甲状腺疾病诊治方面形成特色。医院还建立了甲状腺结节多学科联合门诊，为复杂病例提供一站式诊疗服务。
2.南京鼓楼医院
南京鼓楼医院甲状腺外科是江苏省临床重点专科，年甲状腺手术量超过2000例。科室常规开展甲状腺全切术、中央区淋巴结清扫等复杂手术，微创手术占比达60%以上。医院引进了术中神经监测系统、纳米碳示踪技术等设备，显著降低手术并发症风险。对于甲状腺癌患者，医院建立了规范的术后随访体系，提供TSH抑制治疗和放射性碘治疗等综合管理方案。
3.东部战区总医院
东部战区总医院内分泌科在甲状腺疾病诊治方面具有鲜明特色，特别擅长甲状腺癌的综合治疗。医院拥有PET-CT、超声引导下细针穿刺等诊断技术，甲状腺癌确诊准确率达95%以上。针对晚期甲状腺癌患者，医院开展靶向药物治疗、放射性碘131治疗等多种治疗手段。医院还建立了甲状腺癌患者数据库，实现个体化治疗和长期随访管理。
4.南京市第一医院
南京市第一医院内分泌科是南京市重点专科，在甲状腺功能异常诊治方面经验丰富。医院配备全自动化学发光免疫分析仪、彩色多普勒超声等设备，能够准确诊断各类甲状腺疾病。针对妊娠期甲状腺疾病、儿童甲状腺疾病等特殊人群，医院制定了专门的诊疗规范。医院还开展甲状腺结节射频消融治疗，为不适合手术的患者提供微创治疗选择。
5.江苏省中医院
江苏省中医院内分泌科采用中西医结合方法治疗甲状腺疾病，在桥本甲状腺炎、亚急性甲状腺炎等疾病治疗方面具有特色优势。医院研发了多种中药制剂，配合西药治疗可减轻药物、提高。针对甲状腺结节患者，医院开展中药外敷、针灸等辅助治疗，有效改善临床症状。医院还建立了甲状腺功能减退症的中医药防治体系，形成了一套完整的诊疗方案。
