南京治疗肾结石比较好的医院有江苏省人民医院、南京鼓楼医院、东部战区总医院、南京市第一医院、南京医科大学第二附属医院等。其中江苏省人民医院泌尿外科设备，拥有多种微创碎石技术；南京鼓楼医院结石专科年手术量超千例，配备全套德国进口碎石系统；东部战区总医院采用多学科联合诊疗模式，对复杂肾结石病例经验丰富。
1、江苏省人民医院
江苏省人民医院泌尿外科是国家临床重点专科，设有独立的结石病区。科室拥有瑞士第四代EMS碎石清石系统、德国多尼尔DeltaII体外冲击波碎石机等设备，常规开展经皮肾镜、输尿管软镜等微创手术。针对不同大小和位置的结石，制定个性化治疗方案，年完成结石手术1500余例。医院还建立了结石成分分析实验室，为预防复发提供科学依据。
2、南京鼓楼医院
南京鼓楼医院泌尿外科结石治疗中心配备有德国狼牌输尿管镜、Olympus电子软镜等全套进口设备。特别在复杂肾结石处理方面，采用超声联合气压弹道碎石技术，实现结石粉末化清除。中心开展24小时急诊碎石服务，建立结石患者全程管理档案，术后定期随访。近年来引进超微通道经皮肾镜技术，将手术创伤控制在3毫米以内。
3、东部战区总医院
东部战区总医院泌尿外科在军内率先开展可视化穿刺经皮肾镜手术，对鹿角形结石、多发结石等疑难病例具有丰富经验。科室配备有新一代钬激光碎石系统，结合三维影像导航技术，实现碎石。医院特色是多学科协作诊疗，由泌尿外科、影像科、营养科共同参与，从诊断、治疗到预防形成完整闭环。针对特殊体质患者，提供药物溶石等保守治疗方案。
4、南京市第一医院
南京市第一医院泌尿外科是南京市级重点专科，拥有独立的结石诊疗组。科室引进德国铂立组合式输尿管软镜系统，可弯曲270度探查肾盂各盏。开展体外冲击波碎石、输尿管镜碎石等全套技术，建立结石快速诊疗通道。医院注重术后健康管理，提供代谢评估和饮食指导服务，降低复发风险。
5、南京医科大学第二附属医院
南京医科大学第二附属医院泌尿外科配备有国内首台双导管碎石系统，可同步进行碎石与冲洗。科室创新开展斜仰卧位经皮肾镜手术，提高穿刺性。针对儿童肾结石患者，拥有专用的小儿输尿管镜设备。医院定期举办结石病友会，普及防治知识，建立患者交流平台。
