南京治疗乳腺癌比较好的医院有江苏省人民医院、江苏省肿瘤医院、东南大学附属中大医院、南京鼓楼医院、东部战区总医院等。这些医疗机构在乳腺癌早期筛查、治疗及术后康复领域均具备较高水平。其中江苏省人民医院乳腺疾病诊疗中心配备国际的钼靶定位系统，年手术量超2000例；江苏省肿瘤医院拥有省内乳腺癌生物样本库，开展个体化靶向治疗；东南大学附属中大医院在乳腺癌保乳手术成功率方面达国内水平。
江苏省人民医院
该院乳腺疾病诊疗中心为国家临床重点专科，配置3.0T磁共振引导的穿刺定位系统，实现亚毫米级病灶定位。常规开展乳腺肿瘤微创旋切术、腔镜辅助下乳房重建等前沿技术，建立包含病理、影像、放疗等学科的多维诊疗体系。针对三阴性乳腺癌患者，率先应用循环肿瘤DNA监测技术指导治疗方案调整，五年生存率提升至82%。医院特别开设心理康复门诊，为术后患者提供定制化康复计划。
江苏省肿瘤医院
该院乳腺癌多学科诊疗团队采用国际通用的NCCN指南，建立从基因检测到用药的全程管理体系。拥有容积调强放疗系统，可将心脏受照剂量降低40%。针对HER2阳性患者，开展新辅助治疗联合靶向药物的转化治疗模式，使不可手术患者转化率达35%。医院参与制定《中国乳腺癌骨转移专家共识》，在骨转移灶的放射性核素治疗方面形成特色优势，相关研究成果发表于《柳叶刀·肿瘤学》。
东南大学附属中大医院
该院乳腺病诊治中心配置数字化乳腺导管造影系统，可清晰显示0.5cm以下的导管内病变。在乳腺癌前哨淋巴结活检技术领域保持省内，年完成保乳手术800余例。创新应用术中放疗技术，对早期乳腺癌患者实施单次靶向放射治疗，将术后放疗周期缩短三分之二。医院联合材料学院研发的3D打印乳房假体，获国家发明专利并投入临床使用，外形自然度获患者高度评价。
南京鼓楼医院
该院乳腺外科配备全自动乳腺超声弹性成像系统，对致密型乳腺病变检出率提升25%。开展腔镜下腋窝淋巴结清扫术，创伤较传统术式减少60%。针对晚期乳腺癌患者，建立包含疼痛管理、营养支持的全病程管理模式。医院与英国剑桥大学合作建立的液体活检实验室，可实现乳腺癌复发风险的动态监测，相关技术获江苏省医学新技术引进一等奖。
东部战区总医院
该院采用PET-CT与乳腺专用PET融合显像技术，对多病灶乳腺癌的检出灵敏度达95%。在乳腺癌新辅助化疗领域，建立基于动态增强MRI的预测模型，准确率超85%。针对年轻患者需求，开展自体脂肪移植联合假体植入的复合乳房再造技术，术后满意度达90%。医院研发的智能随访系统可实现治疗后的全程健康管理，自动提醒复查时间并生成个性化建议。
