种植牙的风险和后遗症主要为手术过程中和手术后可能出现的并发症和后遗症。
手术过程中常可出现出血、上颌窦穿通、牙槽脊穿孔、神经损伤等并发症。
黏骨膜剥离损伤大、黏膜下剥离广泛、术后压迫不良、钻孔过深伤及血管等是发生出血的常见原因。上颌窦穿通是口腔种植术时，钻头或种植体进入上颌窦并穿通黏膜，常引起术后的感染，使患者面颊部的疼痛。牙槽脊穿孔多由缺牙时间过长导致牙槽脊过度吸收，牙槽脊宽度不够，钻头易从牙槽脊一侧或根方穿出。术中可能损伤的神经主要为下牙槽神经和颏神经，偶尔也可发生舌神经的损伤。术中若伤及神经可引起局部感觉异常或不寻常的出血。
手术后的并发症常为水肿、感染、种植体早期松动、术后神经功能障碍等。
术后水肿常出现在术后第1天，可有局部的胀痛，伴体温升高，影响伤口愈合。牙种植术后感染多发生于术后2~3周，严重者可造成种植体周围脓肿，致牙种植术失败。种植区急性炎症、种植体过早负荷及颌骨侧壁穿孔等都可引起种植体的早期松动，致使愈合期延长，影响种植体表面与骨组织的结合，造成种植失败。术后神经功能障碍主要包括感觉异常、痛觉丧失等。
