临床诊断强直性脊柱炎时应注意与以下疾病鉴别：
1.脊柱结核病变局限于一个或相邻椎体，以骨质破坏为主，缺乏骨质增生，并有椎旁、腰大肌、髂窝等处寒性脓肿，无广泛强直。
2.骶髂关节结核一般为单侧发病，有明显骨质破坏，缺乏骨质增生和硬化。
3.脊柱退行性变多发生在40岁以上人群。骶髂关节无改变，椎间隙变窄，椎体边缘骨赘形成。
4.类风湿关节炎(RA)AS在男性多发，而RA在女性居多。AS无一例外有骶髂关节受累，类风湿关节炎则很少有骶髂关节病变。AS为全脊柱自下而上地受累，类风湿关节炎只侵犯颈椎。外周关节炎在AS为少数关节、非对称性，且以下肢关节为主;类风湿关节炎则为多关节、对称性和四肢大小关节均可发病。AS无类风湿关节炎可见的类风湿结节。AS的类风湿因子阴性，而类风湿关节炎的阳性率占60％～95％。AS以HLA-B27阳性居多，而类风湿关节炎则与HLA-DR4相关。
