细菌性肝脓肿手术指征：
一、不适用于介入治疗的或者介入治疗失败。
二、脓肿存在多个分隔或者多发性囊肿的囊液粘稠，因为这个时候单纯置管是无法完全的引流脓肿。
三、脓肿穿孔、破裂或者存在并发症。因为这个时候脓肿已经破裂。脓液已经到腹腔里。这时候单纯引流是效果不好的。需要开刀进行把脓液都清除。
四、同时合并有其他需要手术治疗的腹部疾病。比如说恶性肿瘤或者胆道异常等。
同时对于肝脓肿的切开引流和部分的肝叶切除术都是常见的两种手术。需要外科医生根据病人的具体情况来选择。
细菌性肝脓肿是怎么引起的细菌可以经下列途径引起肝脓肿：
第一、通过胆道系统良性或恶性的病变导致胆道梗阻，发生化脓性胆管炎时，细菌沿着胆管上行是引起细菌性肝脓肿的主要原因。
第二、门静脉，如坏疽性阑尾炎、胃肠道的憩室炎，细菌可突破肠道的屏障，经过门静脉入肝，引起肝脓肿。
第三、通过肝动脉，体内任何部位的化脓性感染并发菌血症时，细菌均可经肝动脉入肝。
第四、肝毗邻器官或组织存在感染时，细菌可循淋巴系统侵入或直接扩散感染至肝脏。
第五、开放性肝损伤时，细菌可直接经创伤口，侵入肝脏内引起感染，形成肝脓肿。
