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第一名：复旦大学附属中山医院
复旦大学附属中山医院是国家卫生健康委员会委属事业单位，是复旦大学附属综合性教学医院。医院开业于1937年，是中国人创建和管理的早的大型综合性医院之一，隶属于国立上海医学院，为纪念中国民主革命的先驱孙中山先生而命名。解放后曾称上海第一医学院附属中山医院和上海医科大学附属中山医院，2001年改用现名，沿用至今，是上海市第一批三级甲等医院。经过80年的发展，医院本部目前占地面积9.6万平方米，核定床位2005张。建院至今，共有中国科学院院士3人，中国工程院院士2人。现有高级职称700多人。
第二名：上海交通大学医学院附属瑞金医院
医院共设有46个临床学科和9个公共学科;现有国家教育部重点学科4个(血液病学、内分泌与代谢病学、心血管病学、神经病学);国家临床重点专科项目22个和国家临床重点实验室1个(消化内科、麻醉科、重症医学科、临床护理、骨科、检验科、心血管内科、内分泌科、血液科、儿科消化专业、肾脏内科、皮肤科、神经内科、呼吸内科、急诊科、普外科、烧伤科、感染科、肿瘤中心、老年病科、放射影像、中医肿瘤、内分泌代谢病重点实验室);目前也是国家中西医结合示范单位;上海市重点学科“重中之重”1个，上海市优势学科2个，上海市特色学科1个，上海市重点学科2个，上海市教委及卫生局重点学科6个。医院还设有上海市临床医学中心3个(微创外科、内分泌与代谢病、血液病)，6个市级研究所(上海市伤骨科研究所、上海市高血压研究所、上海市内分泌与代谢病研究所，上海烧伤研究所、上海血液学研究所、上海消化外科研究所)，5个院校级研究所(上海交通大学医学院神经病学研究所、上海交通大学医学院心血管病研究所、瑞金医院感染性疾病和呼吸性疾病研究所、上海交通大学医学院胰腺疾病研究所、上海交通大学医学院肾脏病研究所)，科技部国家重点实验室1个(医学基因组学重点实验室)、教育部重点实验室1个(功能基因组学和人类疾病相关基因研究重点实验室)，卫生部重点实验室2个(人类基因组研究重点实验室、内分泌代谢重点实验室)，上海市重点实验室5个(人类基因组研究重点实验室、中西医结合防治骨关节病重点实验室、心血管生物学重点实验室、上海市内分泌肿瘤学重点实验室和上海市胃肿瘤重点实验室)。
第三名：上海交通大学医学院附属仁济医院
仁济医院建于1844年，是上海开埠后第一所西医医院。医院目前由东西南北四个院区和上海市肿瘤研究所组成，是一个学科门类齐全，集医疗、教学、科研于一体的综合性三级甲等医院：东院区位于浦东陆家嘴金融贸易区内，于1999年10月建成投入使用，占地86,875m2，建筑面积207,740.74m2;西院区位于黄浦区中央商务区内，毗邻外滩，占地7,811m2，建筑面积39,014.83m2;南院区位于闵行区浦江镇，于2012年12月建成投入使用，2020年10月20日整建制并入仁济医院，占地50,055m2，建筑面积82,590m2;北院区位于巨野路灵山路，占地6,744m2，建筑面积17,553.82m2，于2013年7月全面启用;肿瘤所位于斜土路，总建筑面积7,523m2，由癌基因与相关基因国家重点实验室、肿瘤流行病学研究室、十一个相关的研究课题组、辅助部门公共服务平台与《肿瘤》杂志编辑部组成，于2010年10月与仁济医院正式“院所合一”，2019年完成整体转隶，目前由市教委委托上海交通大学医学院管理，具体事务由仁济医院负责。
第四名：复旦大学附属儿科医院
经过70年的发展，医院学科综合实力，临床专科优势突出。拥有一批重点学科和平台，包括：7个国家临床重点专科(新生儿、重症医学科、小儿消化科、中医儿科、新生儿疾病重点实验室、小儿外科、临床护理);4个卫生部临床学科重点专业(新生儿、外科、心血管、传染病);国家新生儿先天性心脏病筛查项目管理办公室;国家儿科专业医疗质量控制中心;国家高通量基因临床诊断基地;国家远程医疗与互联网医学中心儿科协同中心;国家卫生部新生儿疾病重点实验室;国家住院医生规范化培训重点专业基地(儿科);国家新生儿特色保健专科基地。省部级级重点学科和平台有：上海市重中之重临床中心(儿科);上海市儿科疾病临床医学中心;上海市重中之重重点学科(儿科、儿外科);上海市医学重点学科(新生儿)：上海市小儿外科疑难重症临床医学中心、新生儿会诊抢救中心、新生儿先天性心脏病筛查诊治中心、遗传代谢病筛查诊治中心、听力筛查诊治中心;上海市医学专业(呼吸急救);上海市公共卫生重点发展专业(小儿传染病);上海市儿科临床质控中心、上海市新生儿临床质量控制中心、上海市新生儿先天性心脏病筛查质控指导中心;上海市出生缺陷防治重点实验室。
第五名：上海儿童医学中心
医院拥有31个临床科室，规划床位规模1500张，实际开放788张，是我国儿童先心病、血液/肿瘤和发育行为儿科领域高水平的中心之一，拥有6个国家重点学科、国家临床重点专科，设有国家卫健委儿童血液肿瘤重点实验室、上海市临床分子诊断重点实验室、上海市罕见病临床研究中心、上海市小儿心血管病研究所等一批省部级重点实验室、研究所及上海交通大学儿童医学中心儿科临床医学院。同时，医院与十多个国家的三十多个国际医疗机构建立了姐妹合作关系，分别组建了8个国际联合实验室/中心/基地。2010年成为国内通过JCI国际医院认证的儿童专科医院;2018年问鼎上海市政府质量金奖;先后以第一单位(或第一合作单位)获得国家科技进步奖8项(占全国儿童医院获奖总数一半以上);于2017年起蝉联全国文明单位称号。
