核磁共振对肾结石的诊断有重要价值，可以看清结石的大小、位置、形态，以及是否合并积水等。对于小结石，通过多饮水及多运动，部分较小的结石可能会自行排出。对于结石较大不能自行排出者，需行体外冲击波碎石或经尿道取石术等治疗。
1、多饮水及多运动：对于较小的肾结石，可以多饮水，适当进行运动，如上下楼梯、跳绳等，辅助结石排出;
2、体外冲击波碎石：利用高能冲击波结石，达到粉碎结石的目的，是治疗肾结石较为常用的方法。但肾结石大小不一，对于直径小于0.6cm的结石，可能会自行排出;
3、经尿道取石术：适用于较大的结石，可在膀胱镜下通过尿道取石，较大的结石可能无法通过尿道排出;
4、溶石治疗：常用于胱氨酸结石，可遵医嘱口服熊去氧胆酸等溶石药物，大多数患者的结石可以溶解，但需注意的是，长期服用熊去氧胆酸可能会引起胆汁碱化，应注意复查。
患者需注意的是，核磁共振检查前应明确有无肾脏疾病，以免加重病情。此外，如果患者体内有金属植入物，如心脏起搏器、动脉瘤银夹结扎术等，一般不建议进行核磁共振检查。检查前3天应停用肾毒性药物，如氨基糖苷类抗生素、磺胺类药等。
